IMGT Sequence analysis tools

Other tools


IMGT Web resources

IMGT links

Compare your sequence against IMGT/LIGM-DB

General sequence analysis
Analyse de séquences

Align 2 sequences
Aligner 2 séquences
LALIGN Genestream
Translate a nucleotide sequence into an amino acid sequence
Traduire une séquence nucléotidique en une séquence protéique
Translate tool Expasy
Analyse in details an input sequence
Analyser en détails une séquence
Locate a nucleotide or amino acid sequence from the WWW (30-75 characters; spaces and numbers OK)
Localiser une séquence nucléotidique ou protéique sur le Web (30-75 caractères ; espaces et nombres OK)
InstaSeq Instaseq
Convert a DNA sequence into its reverse, complement, or reverse-complement counterpart.
Convertir une séquence d'ADN en son inverse, complémentaire ou inverse-complémentaire.
Reverse Complement
Construct a multiple alignment.
Réaliser un alignement multiple.
ClustalW EBI
Construct a phylogenetic tree.
Réaliser un arbre phylogénétique. Phylogeny

IG and TR sequence analysis
Analyse de séquences IG et TR

Analyse a rearranged V-J or V-D-J gene (works also for germline V genes)
Analyser un gène V-J ou V-D-J réarrangé (valable aussi pour les gènes germline V)
Analyse the V-J or V-D-J junctions (for human and mouse IG and TR)
Analyser les jonctions V-J ou V-D-J (gènes IG et TR de l'homme et de la souris)
IMGT/JunctionAnalysis IMGT
Align 2 alleles
Aligner 2 allèles
IMGT/Allele-Align IMGT
Build a phylogenetic tree for IG and TR V-REGION nucleotide sequences
Construire un arbre phylogénétique de séquences nucléotidiques de V-REGIONs d'IG et TR

Compare a sequence with databases
Comparer une séquence avec les bases de données

Compare a novel sequence with those contained in nucleotide and protein databases
Comparer une nouvelle séquence avec celles de bases de données nucléotidiques et protéiques
(for comparison of IG and TR nucleotide sequences with IMGT/LIGM-DB, click here)