"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
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TRAV1 | TRAV1-1 | TRAV1-1*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 10001..10702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV1-2 | TRAV1-2*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 34270..34937 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV2 | TRAV2 | TRAV2*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 110944..111493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV3 | TRAV3 | TRAV3*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 120534..121004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV4 | TRAV4 | TRAV4*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 132347..133152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV5 | TRAV5 | TRAV5*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 151334..151888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV6 | TRAV6 | TRAV6*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 161259..161825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8 | TRAV8-1 | TRAV8-1*01 | P | (1) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 183967..184473 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-2 | TRAV8-2*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 232009..232507 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-3 | TRAV8-3*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 282316..282823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-4 | TRAV8-4*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 287906..288393 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-5 | TRAV8-5*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 363585..364067 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-6 | TRAV8-6*01 | P | (2) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 468459..468974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-7 | TRAV8-7*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 565119..565633 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9 | TRAV9-1 | TRAV9-1*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 197767..198278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-2 | TRAV9-2*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 325931..326439 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV10 | TRAV10 | TRAV10*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 210903..211509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV11 | TRAV11-1 | TRAV11-1*01 | ORF | (3) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 214891..215772 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV11-2 | TRAV11-2*01 | ORF | (4) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 223797..224073 | (5) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV11-3 | TRAV11-3*01 | P | (6) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 265074..265624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV12 | TRAV12-1 | TRAV12-1*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 226485..227062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV12-2 | TRAV12-2*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 275742..276321 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV12-3 | TRAV12-3*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 350481..351076 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV13 | TRAV13-1 | TRAV13-1*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 253207..253749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV13-2 | TRAV13-2*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 301693..302235 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14 | TRAV14-1 | TRAV14-1*01 | P | (7) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 261056..261600 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14-2 | TRAV14-2*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 307577..308127 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV15 | TRAV15 | TRAV15*01 | P | (8) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 334601..335179 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV16 | TRAV16 | TRAV16*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 375391..375871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV17 | TRAV17 | TRAV17*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 384822..385343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV18 | TRAV18 | TRAV18*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 397068..397570 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV19 | TRAV19 | TRAV19*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 400211..400801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV20 | TRAV20 | TRAV20*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 436192..436721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV21 | TRAV21 | TRAV21*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 446502..447076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV22 | TRAV22-1 | TRAV22-1*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 473354..473911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV22-2 | TRAV22-2*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 489949..490506 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV23 | TRAV23-1 | TRAV23-1*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 488437..488986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV23-2 | TRAV23-2*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 504449..504998 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV23-3 | TRAV23-3*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 515515..516064 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV24 | TRAV24 | TRAV24*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 537641..538184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV25 | TRAV25 | TRAV25*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 544904..545551 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV26 | TRAV26-1 | TRAV26-1*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 555994..556510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV26-2 | TRAV26-2*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 625052..625753 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV27 | TRAV27 | TRAV27*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 582521..583119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV29 | TRAV29 | TRAV29*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 596137..596697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV30 | TRAV30 | TRAV30*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 601846..602444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV32 | TRAV32 | TRAV32*01 | P | (9) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 614768..615042 | (5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV33 | TRAV33 | TRAV33*01 | P | (10) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 619095..619694 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV34 | TRAV34 | TRAV34*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 629836..630468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV35 | TRAV35 | TRAV35*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 642789..643404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV36 | TRAV36 | TRAV36*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 647637..648168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV37 | TRAV37 | TRAV37*01 | ORF | (11) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 678450..679023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV38 | TRAV38-1 | TRAV38-1*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 684713..685337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV38-2 | TRAV38-2*01 | F | 7 | + | + | CM002991.3 | IMGT000013 | 694208..694844 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV39 | TRAV39 | TRAV39*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 717888..718426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV40 | TRAV40 | TRAV40*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 728894..729357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV41 | TRAV41 | TRAV41*01 | F | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 735240..735783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV46 | TRAV46 | TRAV46*01 | P | (14) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 813920..814362 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV46*02 | P | (14) | 7 | IMGT000026 | 52997..53439 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAVA | TRAVA | TRAVA*01 | P | (12) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 177987..178490 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAVB | TRAVB | TRAVB*01 | P | (8) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 245540..246122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAVC | TRAVC | TRAVC*01 | P | (13) | 7 | CM002991.3 | IMGT000013 | 426881..427167 | (5) |