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Brown V. et al. Cell 107, 477-487 (2001) PMID:11719188
Introduction
Lorsque la protéine FMRP est absente, les ARNm normalement associés aux complexes FMRP-mRNP ne sont pas traduits, ce qui, dans le cerveau, entraîne une absence de certains protéines et une perte des facultés cognitives.
Pour tester cette hypothèse, les auteurs ont utilisé des puces à ADN (microarrays, chips) afin d'identifier les messagers sélectivement associée aux complexes FMRP-mRNP dans le cerveau de souris.
Cette immunoprécitipation est suivie de la transcription reverse en ARNc.
On obtient ainsi 4 fractions d'ARNc : ARNc (wt), ARNc (KO), ARNc (wt-IP), ARNc (KO-IP).
Chaque fraction d'ARNc est ensuite hybridée sur des puces à ADN.
Microarrays Affymetrix.
Diagramme de Venn. Détermination du nombre d'ARN associés aux FMRP-mRNP.
Les résultats montrent que 15% des 2.902 gènes (wt-IP versus KO-IP) sont identiques à 82% des 527 gènes (wt-IP versus wt). L'intersection représente 432 gènes, ou 3,9% des 11.067 ARN exprimés.
Ces résultats indiquent que ~4% des messagers du cerveau semblent associés aux FMRP-mRNP ("enrichis" = au moins une augmentation de 4 fois).