Les nucléotides P sont les nucléotides qui constituent la P-REGION. La P-REGION se trouve contigue à un gène qui n'a pas subi de délétion à ses extrémités. Il s'agit de 1, 2 ou 3 nucléotides (rarement plus) qui sont inverses complémentaires de l'extrémité de la séquence du gène (3'V-REGION, 5'D-REGION, 3'D-REGION, 3'J-REGION).
.......ATCG puis .......ATCG .......TA .......TAGC
.......ATCGA puis .......ATCGA .......T .......TAGCT
.......ATCGAT puis .......ATCGAT ........ .......TAGCTA
Ceci s'explique par la formation d'une épingle à cheveu (hairpin) au moment où l'ADN double brin est coupé pour être réarrangé.
.........ATC .........TAG |
] |
Si la coupure se fait entre C et G cela donne une coupure à bouts francs (pas de P nucléotides), si c'est à gauche du G cela donne l'exemple 1, si c'est à gauche du A cela donne l'exemple 2, si c'est à gauche du T cela donne l'exemple 3.