Bienvenue sur le site Web IMGT
IgM
IMGT, the International ImMunoGeneTics information
system®, est le site international de référence en immunogénétique qui
s'adresse aux chercheurs, aux médecins, aux vétérinaires, aux étudiants, aux
industriels des domaines pharmaceutiques et biotechnologiques.
Créée en 1989, à Montpellier, par Marie-Paule Lefranc (Université Montpellier
II, CNRS), IMGT contient toutes les données expertisées sur les immunoglobulines
et les récepteurs T de l'homme et de 155 espèces de vertébrés.
Le site IMGT, ce sont :
des Bases de Données :
- de séquences
- IMGT/LIGM-DB
Base de données des immunoglobulines (IG) et des récepteurs T (TR), sur le réseau depuis Juillet 1995. - IMGT/MHC-DB
Base de données des molécules du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH humain ou HLA sur le réseau depuis Décembre 1998), MHC-NHP CMH des primates non-humains. - IMGT/PRIMER-DB
- IMGT/LIGM-DB
- de gènes
- de structures 3D
des ressources de référence :
- IMGT Repertoire
Ensemble des données expertisées par IMGT.- taxonomie des espèces de vertébrés répertoriées dans IMGT
- localisations chromosomiques des locus des IG et des TR
- représentation des locus des gènes des IG et des TR
- organisation génomique de certains gènes
- tableaux de gènes
- alignements d'allèles
- séquences protéiques et représentations 2D ou "Colliers de perles"
- structures 3D des Immunoglobulines et des récepteurs T
- translocations et inversions impliquant les gènes des IG et des TR
- sondes (phages, probes et RFLP) se rapportant aux différents gènes d'IG et TR
- et depuis peu, des informations sur des molécules autres que les IG et TR mais appartenant à la "superfamille des immunoglobulines".
- IMGT Index
Accès rapide aux informations d'IMGT sans nécessairement être familiarisé avec la carte du site. - IMGT Scientific chart
Ensemble des règles de classification et de description d'IMGT, qui ont permis de définir un vocabulaire précis dans le domaine de l'immunogénétique, la nomenclature standardisée, la numérotation unique des domaines variables et constants... La charte scientifique IMGT repose sur une ontologie développée par IMGT (IMGT-ONTOLOGY). Cette approche standardisée est la clé de voûte de l'expertise d'IMGT. - IMGT Bloc-notes
Ensemble de très nombreux liens sélectionnés vers des sites ayant trait à l'immunologie, la bioinformatique, la génétique, la médecine. On retrouve des liens vers PubMed, les principales bases de données nucléotidiques (EMBL, GenBank, DDBJ), protéiques (SWISS-PROT, PIR), de structures tri-dimensionnelles (PDB), génétiques (OMIM), les serveurs en bioinformatique (EBI, INFOBIOGEN, NCBI,...) les journaux et périodiques scientifiques... - IMGT Aide-mémoire
Rappels biologiques et chimiques fondamentaux (classification périodique des éléments, code génétique...).
des outils :
- IMGT/V-QUEST (V-QUEry and
Standardization)
Outil d'alignement qui permet d'analyser une séquence d'IG et de TR par comparaison à un pool de séquences référencées dans la base. IMGT/V-QUEST fournit la traduction protéique et la représentation 2D ou Collier de Perles de la séquence analysée. - IMGT/JunctionAnalysis
Outil d'analyse des jonctions des gènes réarrangés V-D-J et V-J des IG et des TR humains. - IMGT/LocusView
Outil de visualisation des gènes humains présents sur les chromosomes. - IMGT/Phylogene
Outil qui permet de construire des arbres phylogénétiques. - IMGT/Allele-Align
Outil qui permet d'aligner deux séquences nucléotidiques, de les traduire et de déterminer le nombre de différences au niveau des nucléotides et des acides aminés.
IMGT, La Base de données Internationale en ImMunoGénétique dans Les Technologies de l'Information et de la Communication et la Collaboration Universitaire en Europe.
La première version de cette page de bienvenue sur le site IMGT a été réalisée par les étudiants du module d'Immunologie de la Maîtrise de Biochimie (2000-2001), Université Montpellier 2 :
- Laurence Auger
- Julien Bertrand
- Céline Boursier
- Sara Caudron
- Vanessa Duong
- Lucie Fernandez
- Edith Garrido
- Jessica Hernandez
- Virginie Llanta
- Thomas Marconnet
- Damien Maurel
- Sonia Molina
- Agathe Rostan
- Mathieu Rouard
- Céline Sanchiz
- Bérengère Vire
Last updated: Friday, 22-Sep-2023 18:16:15 CEST
Author: Marie-Paule Lefranc
Editors: Elodie Foulquier and Chantal Ginestoux
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