Structure en domaines
Chaque immunoglobuline comporte 2 chaînes lourdes identiques et
2 chaînes légères identiques. Ces dernières peuvent être des chaînes
kappa ou des chaînes lambda. Ces chaînes sont constituées de domaines
variables et constants.
- Quels sont les domaines d'une chaîne kappa ? lambda ? mu ? gamma ?
Compléter le tableau.
| Domaines |
V |
C |
| chaîne légère kappa |
1 |
1 |
| chaîne légère lambda |
|
|
| chaîne lourde mu |
|
|
| chaîne lourde gamma |
|
|
- Par quoi est codé :
- un domaine variable de chaîne légère ?
- un domaine variable de chaîne lourde ?
- un domaine constant de chaîne légère ?
- un domaine constant de chaîne lourde ?
Structure en Collier de Perles
Chaque chaîne légère ou lourde est une chaîne protéique formée d'un enchaînement d'acides aminés.
Un Collier de Perles peut représenter :
- une région variable (V- REGION)
- un domaine variable (V-DOMAIN)
- un domaine constant (C-DOMAIN)
- Collier de Perles d'une V-REGION. Citer :
- les brins qui sont en feuillet bêta (utiliser la nomenclature des lettres A, B, C)
A, B,...
- les bêta turn
AB,...
- les boucles
BC,...
-
Collier de Perles d'un V-DOMAIN
Consulter IMGT/ 3D structure- DB. Requête "IGHV" + "humain".
Cliquer ensuite dans la colonne "CDR lengths".
Citer les éléments en plus.
- Quelles différences (éléments en plus) voyez-vous entre V-DOMAIN et V- REGION ?
- A quels gènes ou à quelle région correspond la boucle FG ? Le brin G ?
- Collier de Perles d'un C-DOMAIN
Quelles différences voyez-vous entre un V-DOMAIN et un C-DOMAIN ?
Caractéristiques d'une immunoglobuline cristallisée
Une seule immunoglobuline a été complètement cristallisée à ce jour (mai 2002).
-
Quelle est-elle ? Consulter IMGT/3Dstructure-DB. Voir les Colliers de Perles des V-DOMAINs de cette protéine.
-
Quels sont les gènes réarrangés des domaines V de la chaîne lourde et de la chaîne légère de cette protéine ?
Régions spécifiques de liaison à l'antigène
Trois des boucles de la chaîne lourde et trois de la chaîne
légère participent à la reconnaissance de l'antigène. Elles confèrent
la spécificité à l'anticorps.
- Repérer les acides aminés de ces boucles (appelées CDR1, CDR2, CDR3) dans :
- l'alignement protéique (Protein display)
- un Collier de Perles de V-DOMAIN
- la structure 3 D (PDB)
- Observer le Collier de Perles sur deux plans avec liaisons hydrogènes
- Observer la représentation schématique de 2 domaines : chaîne lourde et chaîne légère en vis à vis.
- Created:
- 01/07/2002
- Last updated:
- 22/09/2023
- Authors:
- Amina Mrani and Marie-Paule Lefranc
- Editor:
- Chantal Ginestoux
