IMGT Sequence analysis tools

IMGT Sequence analysis tools

Tools for general sequence analysis
Tools for IG and TR sequence analysis
Compare a sequence with databases

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Compare your sequence against IMGT/LIGM-DB

General sequence analysis
Analyse de séquences

Align 2 sequences Aligner 2 séquences	LALIGN
Translate a nucleotide sequence into an amino acid sequence Traduire une séquence nucléotidique en une séquence protéique	Translate tool
Analyse in details an input sequence Analyser en détails une séquence	SEQUEROME
Locate a nucleotide or amino acid sequence from the WWW (30-75 characters; spaces and numbers OK) Localiser une séquence nucléotidique ou protéique sur le Web (30-75 caractères ; espaces et nombres OK)	InstaSeq
Convert a DNA sequence into its reverse, complement, or reverse-complement counterpart. Convertir une séquence d'ADN en son inverse, complémentaire ou inverse-complémentaire.	Reverse Complement	Reverse Complement
Construct a multiple alignment. Réaliser un alignement multiple.	ClustalW
Construct a phylogenetic tree. Réaliser un arbre phylogénétique.	PhyloGeny.fr

IG and TR sequence analysis
Analyse de séquences IG et TR

Analyse a rearranged V-J or V-D-J gene (works also for germline V genes) Analyser un gène V-J ou V-D-J réarrangé (valable aussi pour les gènes germline V)	IMGT/V-QUEST
Analyse the V-J or V-D-J junctions (for human and mouse IG and TR) Analyser les jonctions V-J ou V-D-J (gènes IG et TR de l'homme et de la souris)	IMGT/JunctionAnalysis
Align 2 alleles Aligner 2 allèles	IMGT/Allele-Align
Build a phylogenetic tree for IG and TR V-REGION nucleotide sequences Construire un arbre phylogénétique de séquences nucléotidiques de V-REGIONs d'IG et TR	IMGT/PhyloGene

Compare a sequence with databases
Comparer une séquence avec les bases de données

Compare a novel sequence with those contained in nucleotide and protein databases Comparer une nouvelle séquence avec celles de bases de données nucléotidiques et protéiques	BLAST (for comparison of IG and TR nucleotide sequences with IMGT/LIGM-DB, click here)

Tutorial

From gene to protein analysis (IMGT Education)