Citing IMGT dynamic tools: Sanou G., Zeitoun G. et al. IMGT® at scale: FAIR, Dynamic and Automated Tools for Immune Locus Analysis, Nucleic Acids Research. 2025;,gkaf1024. doi: 10.1093/nar/gkaf1024 (Free Article) PMID: 41091930.
Select a species and a locus:
Only IMGT available species/locus are shown in the drop-down list.

Sumatran orangutan (Pongo abelii) TRA locus (on chromosome 15) gene repertoire per assembly:

Sumatran orangutan (Pongo abelii) TRAV gene numbers per subgroup in IMGT annotated assemblies:

For each available species and locus, the evaluation of a locus gene repertoire is displayed in tables per gene type: V, D, J or C.
The first column on the left lists either IMGT subgroups for V genes, or IMGT sets or subgroups for D and J genes, or IMGT gene names for constant genes. Clicking on the link provides the lists of corresponding IMGT alleles per IMGT functionality.
Columns in «IMGT annotated assemblies» display for each IMGT annotated assembly the number of IMGT genes per functionality.
The two columns in «Number of genes» are shown only if there is more than one IMGT annotated assembly. These columns display the numbers of genes which are either «common to all IMGT annotated assemblies» or «Not common to all IMGT annotated assemblies».
The numbers of IMGT genes in the tables are provided per functionality (F for functional, O for ORF, P for pseudogene). If IMGT alleles for a given IMGT gene have different functionalities, these are concatenated (for example: 1 FOP).

Subgroup IMGT annotated assembliesNumber of genes
NHGRI_mPonAbe1-v2.0_priNHGRI_mPonAbe1-v2.0_altCommon to all IMGT
annotated assemblies		Not common to all IMGT
annotated assemblies
TRAV12 F2 F2 F0
TRAV21 P1 O1 OP0
TRAV31 F1 F1 F0
TRAV41 O1 O1 O0
TRAV51 F1 F1 F0
TRAV61 F1 F1 F0
TRAV71 F1 F1 F0
TRAV85 F + 4 P5 F + 4 P5 F + 4 P0
TRAV92 F2 F2 F0
TRAV101 F1 F1 F0
TRAV111 O + 1 P2 P1 OP + 1 P0
TRAV123 F3 F3 F0
TRAV132 F2 F2 F0
TRAV141 F + 1 P1 F + 1 P1 F + 1 P0
TRAV151 P1 P1 P0
TRAV161 F1 F1 F0
TRAV171 F1 F1 F0
TRAV181 F1 F1 F0
TRAV191 F1 F1 F0
TRAV201 P1 P1 P0
TRAV211 F1 F1 F0
TRAV221 F1 F1 F0
TRAV231 F1 F1 F0
TRAV241 P1 P1 P0
TRAV251 F1 F1 F0
TRAV262 F2 F2 F0
TRAV271 F1 F1 F0
TRAV281 P1 P1 P0
TRAV291 F1 F1 F0
TRAV301 F1 F1 F0
TRAV311 P1 P1 P0
TRAV321 P1 P1 P0
TRAV331 P1 P1 P0
TRAV341 F1 F1 F0
TRAV351 F1 F1 F0
TRAV361 F1 F1 F0
TRAV371 P1 P1 P0
TRAV382 F2 F2 F0
TRAV391 F1 F1 F0
TRAV401 F1 F1 F0
TRAV411 F1 F1 F0
TRAV461 P1 P1 P0
TRAVA1 P1 P1 P0
TRAVB1 P1 P1 P0
TRAVC1 P1 P1 P0
TRAVD1 P1 P1 P0
Total number of IMGT genes41 F + 2 O + 20 P
65%
3%
32%
41 F + 2 O + 20 P
65%
3%
32%
41 F + 1 O + 2 OP + 19 P0
Sumatran orangutan (Pongo abelii) TRAJ gene numbers per set or subgroup in IMGT annotated assemblies:
Set or subgroup IMGT annotated assembliesNumber of genes
NHGRI_mPonAbe1-v2.0_priNHGRI_mPonAbe1-v2.0_altCommon to all IMGT
annotated assemblies		Not common to all IMGT
annotated assemblies
TRAJ11 P1 P1 P0
TRAJ21 F1 F1 F0
TRAJ31 F1 F1 F0
TRAJ41 F1 F1 F0
TRAJ51 F1 F1 F0
TRAJ61 F1 F1 F0
TRAJ71 F1 F1 F0
TRAJ81 F1 F1 F0
TRAJ91 F1 F1 F0
TRAJ101 F1 F1 F0
TRAJ111 F1 F1 F0
TRAJ121 F1 F1 F0
TRAJ131 F1 F1 F0
TRAJ141 F1 F1 F0
TRAJ151 F1 F1 F0
TRAJ161 O1 O1 O0
TRAJ171 F1 F1 F0
TRAJ181 F1 F1 F0
TRAJ191 O1 O1 O0
TRAJ201 F1 F1 F0
TRAJ211 F1 F1 F0
TRAJ221 F1 F1 F0
TRAJ231 F1 O1 FO0
TRAJ241 F1 F1 F0
TRAJ251 F1 F1 F0
TRAJ261 F1 F1 F0
TRAJ271 F1 F1 F0
TRAJ281 F1 F1 F0
TRAJ291 F1 F1 F0
TRAJ301 F1 F1 F0
TRAJ311 F1 F1 F0
TRAJ321 F1 F1 F0
TRAJ331 F1 F1 F0
TRAJ341 F1 F1 F0
TRAJ351 F1 F1 F0
TRAJ361 F1 F1 F0
TRAJ371 F1 F1 F0
TRAJ381 F1 F1 F0
TRAJ391 F1 F1 F0
TRAJ401 F1 F1 F0
TRAJ411 F1 F1 F0
TRAJ421 F1 F1 F0
TRAJ431 F1 F1 F0
TRAJ441 F1 F1 F0
TRAJ451 P1 P1 P0
TRAJ461 F1 F1 F0
TRAJ471 F1 F1 F0
TRAJ481 F1 F1 F0
TRAJ491 F1 F1 F0
TRAJ501 F1 F1 F0
TRAJ511 P1 P1 P0
TRAJ521 F1 F1 F0
TRAJ531 F1 F1 F0
TRAJ541 F1 F1 F0
TRAJ551 P1 P1 P0
TRAJ561 F1 F1 F0
TRAJ571 O1 O1 O0
TRAJ581 F1 F1 F0
TRAJ591 O1 O1 O0
TRAJ601 P1 P1 P0
TRAJ611 P1 P1 P0
Total number of IMGT genes51 F + 4 O + 6 P
84%
7%
10%
50 F + 5 O + 6 P
82%
8%
10%
50 F + 1 FO + 4 O + 6 P0
Sumatran orangutan (Pongo abelii) TRAC gene numbers per gene name in IMGT annotated assemblies:
Gene name IMGT annotated assembliesNumber of genes
NHGRI_mPonAbe1-v2.0_priNHGRI_mPonAbe1-v2.0_altCommon to all IMGT
annotated assemblies		Not common to all IMGT
annotated assemblies
TRAC1 F1 F1 F0
Total number of IMGT genes1 F
100%
1 F
100%
1 F0
Sumatran orangutan (Pongo abelii) TRA alleles per subgroup (set or gene name) and functionality in IMGT annotated assemblies:

The table displays IMGT alleles identified for Sumatran orangutan (Pongo abelii) TRA locus per subgroup and functionality (F, O, P) in IMGT annotated assemblies.
Sign # indicates IMGT genes which are not common to all IMGT annotated assemblies.

Subgroup (set or gene name) NHGRI_mPonAbe1-v2.0_pri NHGRI_mPonAbe1-v2.0_alt
F O P F O P
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