"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
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TRAV2 | TRAV2 | TRAV2*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 9834..10618 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV3 | TRAV3 | TRAV3*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 18306..18773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV4 | TRAV4 | TRAV4*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 25749..26575 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV5 | TRAV5 | TRAV5*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 33682..34457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV6 | TRAV6 | TRAV6*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 40523..41092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8 | TRAV8-1 | TRAV8-1*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 21020..21536 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-2 | TRAV8-2*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 54400..54911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-3 | TRAV8-3*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 66462..66946 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-4 | TRAV8-4*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 161864..162348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-5 | TRAV8-5*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 252837..253331 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-6 | TRAV8-6*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 331853..332353 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV8-7 | TRAV8-7*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 369486..369996 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9 | TRAV9-1 | TRAV9-1*01 | P | (2) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 48846..49126 | (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-2 | TRAV9-2*01 | ORF | (4) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 59355..59901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-3 | TRAV9-3*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 112816..113315 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-4 | TRAV9-4*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 129428..129927 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-5 | TRAV9-5*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 156390..156886 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-6 | TRAV9-6*01 | P | (5) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 187359..187853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV9-7 | TRAV9-7*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 228575..229074 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV10 | TRAV10 | TRAV10*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 236273..236878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV11 | TRAV11 | TRAV11*01 | P | (6) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 238844..239021 | (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV12 | TRAV12 | TRAV12*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 248538..249121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV13 | TRAV13-1 | TRAV13-1*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 85704..86220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV13-2 | TRAV13-2*01 | P | (14) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 176686..176966 | (3) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV13-3 | TRAV13-3*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 211347..211890 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14 | TRAV14-1 | TRAV14-1*01 | P | (7) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 101841..102389 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14-2 | TRAV14-2*01 | P | (8) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 123788..124311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14-3 | TRAV14-3*01 | P | (9) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 147629..147913 | (3) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14-4 | TRAV14-4*01 | P | (10) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 184918..185206 | (3) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV14-5 | TRAV14-5*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 215699..216253 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV16 | TRAV16 | TRAV16*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 258478..258954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV17 | TRAV17 | TRAV17*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 264589..265166 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV18 | TRAV18 | TRAV18*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 271270..271778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV19 | TRAV19 | TRAV19*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 286036..286630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV20 | TRAV20 | TRAV20*01 | P | (11) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 303096..303632 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV21 | TRAV21 | TRAV21*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 315779..316350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV22 | TRAV22 | TRAV22*01 | ORF | (12) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 337325..337912 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV23 | TRAV23 | TRAV23*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 345131..345672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV24 | TRAV24 | TRAV24*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 359657..360202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV25 | TRAV25 | TRAV25*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 366980..367604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV26 | TRAV26 | TRAV26*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 413481..414188 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV27 | TRAV27 | TRAV27*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 379177..379718 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV28 | TRAV28 | TRAV28*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 386708..387303 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV29 | TRAV29 | TRAV29*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 392391..392958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV30 | TRAV30 | TRAV30*01 | P | (6) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 398477..398753 | (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV31 | TRAV31 | TRAV31*01 | P | (13) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 401879..402166 | (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV33 | TRAV33 | TRAV33*01 | ORF | (18) (19) | B3 | Abyssinian | TRDV2/TRDV2-1, CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 410470..411077 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV34 | TRAV34 | TRAV34*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 423860..424494 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV35 | TRAV35 | TRAV35*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 429511..430123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV36 | TRAV36 | TRAV36*01 | ORF | (1) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 437799..438359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV37 | TRAV37 | TRAV37*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 451927..452457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV38 | TRAV38-1 | TRAV38-1*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 456929..457544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV38-2 | TRAV38-2*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 464346..464964 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV39 | TRAV39 | TRAV39*01 | P | (14) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 481198..481469 | (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV40 | TRAV40 | TRAV40*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 494967..495454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV41 | TRAV41 | TRAV41*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 498168..498734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV43 | TRAV43-1 | TRAV43-1*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 27798..28356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV43-2 | TRAV43-2*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 79713..80272 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV43-3 | TRAV43-3*01 | F | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 138857..139415 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV43-4 | TRAV43-4*01 | P | (15) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 171624..172181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV43-5 | TRAV43-5*01 | P | (16) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 199351..199910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV43-6 | TRAV43-6*01 | P | (17) | B3 | Abyssinian | CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 202792..203354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAV46 | TRAV46 | TRAV46*01 | F | B3 | Abyssinian | TRDV6, CM001383.3 | IMGT000045 | MAP | 649966..650406 |
MAP: Mapped reference sequences.