"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
Click on:
Positions in the sequence: limits from the first nucleotide of C-REGION to the last nucleotide.
IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Strain | Clone names | Exons | Accession numbers | Positions in the sequence (exons) | Secondary accession numbers | Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (exons) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM1 | IGHM1*01 | F | CH1 | DQ400445 | [1] | 209722-210027 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | DQ400445 | [1] | 211807-212112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | DQ400445 | [1] | 212559-212861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | DQ400445 | [1] | 213096-213484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | DQ400445 | [1] | 215390-215523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | DQ400445 | [1] | 217807-217812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM1*02 | F | lambda12c | CH1 | X52617 | [2] | 99-404 | C7 | M74041 | [3] | (1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X79482 | [4] | 2129-2434 | NG70 | M27230 | [5] | c(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | X52617 | [2] | 2172-2477 | NG70 | M27230 | [5] | c(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X79482 | [4] | 4202-4507 | HG103 | M23733 | [6] | (2) | c(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | X52617 | [2] | (3) | 2925-3227 | NG70 | M27230 | [5] | c(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X79482 | [4] | (3) | 4955-5257 | HG103 | M23733 | [6] | c(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | X52617 | [2] | (3) | 3462-3850 | NG70 | M27230 | [5] | c(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X79482 | [4] | (3) | 5492-5880 | HG103 | M23733 | [6] | c(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | X52617 | [2] | (3) | 5743-5876 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X79482 | [4] | (3) | 7773-7906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | X52617 | [2] | 8163-8168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X79482 | [4] | 10193-10198 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM1*03 | (F) | M5 | CH1 | U67437 | [7] | (4) | c(m) | 418-723 | 3B11D1 | U67440 | [7] | (6) | c(m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
40.VH6 | U67445 | [7] | (7) | c(m) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3B11M1 | CH1 | U67439 | [7] | (5) | c(m) | 350-655 | 21.VH2 | U67441 | [7] | (7) | c(m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | U67439 | [7] | (5) | c(m) | 656-781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM2 | IGHM2*01 | P | IgD-6 | CH2 | AF363449 | [8] | (8,9) | 1863-2128 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AF363449 | [8] | (9) | 4803-5042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | AF363449 | [8] | (9) | 5282-5389 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM3 | IGHM3*01 | P | Cu1 | CH1 | AF068137 | [9] | (10,8) | 5901-6183 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cu2 | CH2 | AF068137 | [9] | (10) | 9409-9695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1 | IGHD1*01 | F | CH1 | DQ400445 | [1] | 219399-219704 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | DQ400445 | [1] | 219787-220077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | DQ400445 | [1] | 220458-220763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | DQ400445 | [1] | 221733-222014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D | DQ400445 | [1] | 222130-222420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3D | DQ400445 | [1] | 222805-223110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D | DQ400445 | [1] | 224078-224359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D2 | DQ400445 | [1] | 224475-224765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3D2 | DQ400445 | [1] | 225122-225427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D2 | DQ400445 | [1] | 225994-226290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH5 | DQ400445 | [1] | (11) | 226410-226733 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH6 | DQ400445 | [1] | 227513-227830 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH7 | DQ400445 | [1] | 228839-229126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | DQ400445 | [1] | 229427-229587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1*02 | F | IgD-2 | CH1 | AF363448 | [8] | 1323-1628 | lambda12c | X79482 | [4] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AF363448 | [8] | (10) | 1711-2001 | lambda12c | X79482 | [4] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AF363448 | [8] | 2346-2651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | AF363448 | [8] | 3618-3899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D | AF363448 | [8] | 4015-4305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3D | AF363448 | [8] | 4674-4979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D | AF363448 | [8] | 5546-5842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH5 | AF363448 | [8] | 5962-6288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH6 | AF363448 | [8] | 7067-7384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH7 | AF363448 | [8] | 8471-8758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | AF363448 | [8] | 9059-9207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | AF363448 | [8] | 10080-10085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1*03 | (F) | M5 | CH1 | U67437 | [7] | (4) | c(m) | 724-1029 | 3B11D1 | U67440 | [7] | (6) | c(m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | U67437 | [7] | c(m) | 1030-1320 | 3B11D1 | U67440 | [7] | (6) | c(m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | U67437 | [7] | c(m) | 1321-1626 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D | U67437 | [7] | c(m) | 1627-1923 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH5 | U67437 | [7] | c(m) | 1924-2247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH6 | U67437 | [7] | c(m) | 2248-2565 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH7 | U67437 | [7] | c(m) | 2566-2853 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | U67437 | [7] | c(m) | 2854-3015 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1*04 | (F) | 21.VH2 | CH1 | U67441 | [7] | (7) | c(m) | 685-986 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1*05 | (F) | 40.VH6 | CH1 | U67445 | [7] | (7) | c(m) | 325-630 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2 | IGHD2*01 | F | IgD-6 | CH1 | AF363449 | [8] | (12) | 7671-7976 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AF363449 | [8] | (12) | 8059-8349 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AF363449 | [8] | (12) | 8750-9055 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | AF363449 | [8] | (12) | 10046-10327 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D | AF363449 | [8] | (12) | 10443-10733 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3D | AF363449 | [8] | (12) | 11106-11411 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D | AF363449 | [8] | (12) | 11978-12274 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH5 | AF363449 | [8] | (12) | 12394-12720 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2*02 | F | IgD-3 | CH1 | AF363450 | [8] | (1) | 1-33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AF363450 | [8] | (1) | 115-405 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AF363450 | [8] | (1) | 790-1095 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | AF363450 | [8] | (1) | 2067-2348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D | AF363450 | [8] | (1) | 2464-2754 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3D | AF363450 | [8] | (1) | 3127-3432 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D | AF363450 | [8] | (1) | 3999-4295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH5 | AF363450 | [8] | (1) | 4415-4741 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH6 | AF363450 | [8] | (1) | 5499-5816 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH7 | AF363450 | [8] | (1) | 6740-7027 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CHS | AF363450 | [8] | (1) | 7340-7410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2*03 | (F) | S1 | CH6 | U67438 | [7] | (13) | c(s) | 1-137 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH7 | U67438 | [7] | (13) | c(s) | 138-425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CHS | U67438 | [7] | (13) | c(s) | 426-497 |
(s) Trancript of a secreted chain.
(m) Trancript of a membrane chain.