"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Haplotypes | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Strain | Clone names | Exons | Accession numbers | Positions in the sequence | Secondary accession numbers | Strain | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHA | IGHA*01 | F | ch28.MF.Ig epsillon-alpha.5 | CH1 | X53705 | [2] | 291-590 | ch28.MF.Ig epsillon-alpha.10 | X53389 | [1] | (2) | 291-590 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H+CH2 | (1) | X53705 | [2] | 804-1130 | ch28.MF.Ig epsillon-alpha.10 | X53389 | [1] | (2) | 804->868 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | X53705 | [2] | 1341-1732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHA*02 | F | CH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UTS362A | H+CH2 | (1) | AB013758 | [6] | (3) | 9-45 | (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHA*03 | F | CH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UTS362B | H+CH2 | (1) | AB013764 | [6] | (3) | 9-51 | (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD | IGHD*01 | ORF | (6) | CH1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1658122-1658430) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1657537-1657638) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H2 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1654027-1654090) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1652972-1653295) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1652345-1652668) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CHS | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1650397-1650422) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1649438-1649595) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1649149-1649154) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG1 | IGHG1*01 | F | CH1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1582921-1583214) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1582476-1582529) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1582028-1582357) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1581611-1581930) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1580180-1580310) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1580255-1580310) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG1*02 | (F) | + | 4D5 | CH1 | AF045536 | [5] | c(s) | 1-294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | AF045536 | [5] | c(s) | 295-348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AF045536 | [5] | c(s) | 349-678 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | AF045536 | [5] | c(s) | 679-999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG1*03 | (F) | + | CH1 | CS101552 | [7] | c(s) | 1-294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | CS101552 | [7] | c(s) | 295-348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | CS101552 | [7] | c(s) | 349-678 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | CS101552 | [7] | c(s) | 679-999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG1*04 | F | + | CH1 | JQ868728 | [8] | (4) | 25-301 | (7) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | JQ868728 | [8] | (4) | 691-744 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | JQ868728 | [8] | (4) | 863-1192 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | JQ868728 | [8] | (4) | 1290-1561 | (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG1*05 | (F) | + | CH1 | L13307 | [3] | (5) | c(s) | 373-666 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | L13307 | [3] | (5) | c(s) | 667-720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | L13307 | [3] | (5) | c(s) | 721-1038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | L13307 | [3] | (5) | c(s) | 1039-1359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG2 | IGHG2*01 | F | CH1 | CS101554 | [7] | 2-295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | CS101554 | [7] | 684-719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | CS101554 | [7] | 838-1164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | CS101554 | [7] | 1262-1581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG2*02 | F | CH1 | JQ868729 | [8] | (4) | 25-301 | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | JQ868729 | [8] | (4) | 690-725 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | JQ868729 | [8] | (4) | 844-1170 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | JQ868729 | [8] | (4) | 1268-1539 | (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG3 | IGHG3*01 | (F) | + | CH1 | CS101564 | [7] | c(s) | 10-300 | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | CS101564 | [7] | c(s) | 301-351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | CS101564 | [7] | c(s) | 352-681 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | CS101564 | [7] | c(s) | 682-1002 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG3*02 | F | CH1 | JQ868730 | [8] | (4) | 25-301 | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | JQ868730 | [8] | (4) | 691-741 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | JQ868730 | [8] | (4) | 860-1189 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | JQ868730 | [8] | (4) | 1287-1558 | (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG4 | IGHG4*01 | F | CH1 | CS101556 | [7] | 2-295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | CS101556 | [7] | 685-714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | CS101556 | [7] | 833-1162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | CS101556 | [7] | 1260-1579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHG4*02 | F | CH1 | JQ868731 | [8] | (4) | 25-301 | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | JQ868731 | [8] | (4) | 695-724 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | JQ868731 | [8] | (4) | 843-1172 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3(including CHS) | JQ868731 | [8] | (4) | 1270-1541 | (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM | IGHM*01 | F | CH1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1669701-1670015) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1669274-1669609) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1668734-1669051) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4(including CHS) | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1668162-1668553) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | Macfas_2_Chr7 | [9] | complement(1666047-1666087) | (8) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 |
c: cDNA sequence.
(s): trancript of a secreted chain.