IMGT Repertoire (IG and TR)
Gene table: sheep (Ovis aries) TRBV
- Fct: FUNCTIONALITY
- F: Functional
- P: Pseudogene
- ORF: Open Reading Frame
- R: Rearranged
- T: Transcribed
- Pr: Translated into protein
"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
Click on:
- IMGT gene name to get the corresponding IMGT/GENE-DB entry,
- IMGT allele name to see the corresponding Alignments of alleles,
- accession number to get the corresponding IMGT/LIGM-DB entry.
| IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV1 | TRBV1 | TRBV1*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 15897..16560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV2 | TRBV2 | TRBV2*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 103224..103715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3 | TRBV3 | TRBV3*01 | F | (1) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 94528..95027 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4 | TRBV4 | TRBV4*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 98990..99484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5 | TRBV5-1 | TRBV5-1*01 | P | (2) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 111236..>111389 | (23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-2 | TRBV5-2*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 116721..117235 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-3 | TRBV5-3*01 | ORF | (3) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 125474..125988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-4 | TRBV5-4*01 | P | (4) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 131980..132492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-5 | TRBV5-5*01 | F | 4 | + | + | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 135043..135554 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-6 | TRBV5-6*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 139073..139588 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-7 | TRBV5-7*01 | P | (5) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 143495..144005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-8 | TRBV5-8*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 148862..149376 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-9 | TRBV5-9*01 | P | (6) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 152552..153041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-10 | TRBV5-10*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 157427..157924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-11 | TRBV5-11*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 164276..164791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-12 | TRBV5-12*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 168252..168764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-13 | TRBV5-13*01 | F | 4 | + | + | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 173077..173592 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-14 | TRBV5-14*01 | P | (6) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 176501..177010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-15 | TRBV5-15*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 180637..181133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-16 | TRBV5-16*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 188629..189146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-17 | TRBV5-17*01 | P | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 192816..193330 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-18 | TRBV5-18*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 197757..198272 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-19 | TRBV5-19*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 205865..206379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-20 | TRBV5-20*01 | P | (5) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 212915..213401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-21 | TRBV5-21*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 216997..217493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-22 | TRBV5-22*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 223860..224377 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-23 | TRBV5-23*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 227991..228507 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-24 | TRBV5-24*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 236346..236843 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-25 | TRBV5-25*01 | ORF | (9) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 246102..246600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-26 | TRBV5-26*01 | ORF | (10) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 250074..250589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-27 | TRBV5-27*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 253470..253983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-28 | TRBV5-28*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 257456..257971 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-29 | TRBV5-29*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 261783..262279 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-30 | TRBV5-30*01 | ORF | (3) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 268599..269112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-31 | TRBV5-31*01 | ORF | (11) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 272723..273239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-32 | TRBV5-32*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 290465..290971 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-33 | TRBV5-33*01 | P | (12) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 300723..301003 | (23) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6 | TRBV6-1 | TRBV6-1*01 | ORF | (11) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 121624..122093 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-2 | TRBV6-2*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 129417..129886 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-3 | TRBV6-3*01 | P | (13) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 136849..137318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-4 | TRBV6-4*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 146565..147034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-5 | TRBV6-5*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 150711..151179 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-6 | TRBV6-6*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 154464..154933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-7 | TRBV6-7*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 155239..155707 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-8 | TRBV6-8*01 | P | (6) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 162028..162495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-9 | TRBV6-9*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 166002..166471 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-10 | TRBV6-10*01 | P | (14) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 170591..171260 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-11 | TRBV6-11*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 174781..175266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-12 | TRBV6-12*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 178444..178911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-13 | TRBV6-13*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 186377..186803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-14 | TRBV6-14*01 | ORF | (13) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 190506..190975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-15 | TRBV6-15*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 199460..199929 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-16 | TRBV6-16*01 | ORF | (15) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 202779..203249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-17 | TRBV6-17*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 211189..211656 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-18 | TRBV6-18*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 214797..215263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-19 | TRBV6-19*01 | P | (16) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 221560..222023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-20 | TRBV6-20*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 225726..226194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-21 | TRBV6-21*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 230826..231295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-22 | TRBV6-22*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 234151..234619 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-23 | TRBV6-23*01 | P | (17) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 243797..244262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-24 | TRBV6-24*01 | P | (17) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 247812..248281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-25 | TRBV6-25*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 251775..252259 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-26 | TRBV6-26*01 | P | (8) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 255205..255671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-27 | TRBV6-27*01 | F | 4 | + | + | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 259778..260248 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-28 | TRBV6-28*01 | ORF | (18) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 266349..266810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-29 | TRBV6-29*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 270471..270940 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-30 | TRBV6-30*01 | ORF | (11) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 275541..276009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7 | TRBV7-1 | TRBV7-1*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 278374..278865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-2 | TRBV7-2*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 295409..295937 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV8 | TRBV8 | TRBV8*01 | P | (12) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 282550..282848 | (23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV10 | TRBV10 | TRBV10*01 | P | (6) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 306284..306754 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV11 | TRBV11 | TRBV11*01 | P | (19) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 310722..311217 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12 | TRBV12-1 | TRBV12-1*01 | ORF | (11) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 317719..318201 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-2 | TRBV12-2*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 333203..333684 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV14 | TRBV14 | TRBV14*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 335755..336223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV15 | TRBV15 | TRBV15*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 338052..338555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV16 | TRBV16 | TRBV16*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 343090..343581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV18 | TRBV18 | TRBV18*01 | P | (20) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 354905..355563 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV19 | TRBV19 | TRBV19*01 | ORF | (11) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 356903..357395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV20 | TRBV20 | TRBV20*01 | F | 4 | + | + | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 361947..362799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21 | TRBV21-1 | TRBV21-1*01 | P | (21) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 368995..369488 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21-2 | TRBV21-2*01 | F | (1) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 372786..373267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21-3 | TRBV21-3*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 381785..382273 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21-4 | TRBV21-4*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 386239..386738 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21-5 | TRBV21-5*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 390307..390795 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21-6 | TRBV21-6*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 396613..397106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV22 | TRBV22 | TRBV22*01 | P | (22) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 401327..401606 | (23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV24 | TRBV24 | TRBV24*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 404874..405386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV25 | TRBV25 | TRBV25*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 411210..411719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV26 | TRBV26 | TRBV26*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 413128..413646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV27 | TRBV27 | TRBV27*01 | P | (7) | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 424923..425431 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV28 | TRBV28 | TRBV28*01 | F | 4 | + | + | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 430819..431530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV29 | TRBV29 | TRBV29*01 | F | 4 | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | 438448..439081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV30 | TRBV30 | TRBV30*01 | F | 4 | Romanov | AM420900 | [1] | complement(40347..41045) | Rambouillet | CM008475.1 | IMGT000042 | MAP | complement(495273..495971) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MAP: Mapped reference sequences.
IMGT notes:
- (1) STOP-CODON at position 108 (last 3' codon of germline CDR3-IMGT) may disappear during rearrangements
- (2) STOP-CODON in V-REGION, frameshift in V-REGION, deletions in V-REGION: AA 56 to 108 are missing
- (3) noncanonical DONOR-SPLICE
- (4) STOP-CODON in V-REGION, frameshift in V-REGION
- (5) frameshift in L-PART1, frameshift in V-REGION
- (6) frameshifts in V-REGION
- (7) frameshift in V-REGION
- (8) STOP-CODON in V-REGION
- (9) deletions in V-REGION: 6 AA are missing
- (10) no 2nd-CYS, noncanonical V-NONAMER
- (11) noncanonical V-NONAMER
- (12) no L-PART1, frameshifts in V-REGION
- (13) no CONSERVED-TRP
- (14) insertion of 67 AA between FR1-IMGT and CDR1-IMGT
- (15) noncanonical ACCEPTOR-SPLICE
- (16) STOP-CODON in V-REGION, frameshifts in V-REGION
- (17) several STOP-CODON in V-REGION
- (18) noncanonical V-HEPTAMER
- (19) frameshift in L-PART2, STOP-CODON in V-REGION
- (20) no INIT-CODON, STOP-CODON in L-PART1, no DONOR-SPLICE, several STOP-CODON in V-REGION, frameshifts in V-REGION
- (21) frameshift in L-PART1
- (22) no V-NONAMER
- (23) Positions of V-REGION
IMGT references:
- [1] R. Antonacci, et al. Mol. Immunol. 45(2):493-509 (2008). PMID:17673294
More information:
See also (IMGT Scientific chart):
- Created:
- 02/04/2019
- Last updated:
- 21/08/2024
- Authors:
- Perrine Pégorier
