"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Isolate | Clone names | Exons | Accession numbers | Positions in the sequence (exons) | Secondary accession numbers | Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (exons) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHT1 | IGHT1*01 | P | (1) | Swanson | CM007947.1 | CH1 | IMGT000043 | 217956..218254 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | IMGT000043 | 218444..218728 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | IMGT000043 | 218858..219175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | IMGT000043 | 219512..219850 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | IMGT000043 | 220645..220799 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | IMGT000043 | 220958..220966 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHT1D*01 | P | (2) | Swanson | CM007946.1 | CH1 | IMGT000044 | 377341..377640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | IMGT000044 | 377842..378126 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | IMGT000044 | 378251..378556 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | IMGT000044 | 378879..379213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | IMGT000044 | 380028..380182 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | IMGT000044 | 380663..380671 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHT2 | IGHT2*01 | F | Swanson | CM007947.1 | CH1 | IMGT000043 | 272195..272494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | IMGT000043 | 272701..272985 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | IMGT000043 | 273110..273427 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | IMGT000043 | 273749..274086 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | IMGT000043 | 274890..275044 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | IMGT000043 | 275413..275421 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHT2*02 | F | + | IGHT | CH1 | AY872256 | [1] | 32066..32365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AY872256 | [1] | 32572..32856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AY872256 | [1] | 32981..33302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | AY872256 | [1] | 33620..33957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | AY872256 | [1] | 34749..34903 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | AY872256 | [1] | 35243..35251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM | IGHM*01 | F | Swanson | CM007947.1 | CH1 | IMGT000043 | 93022-93318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | IMGT000043 | 94474-94815 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | IMGT000043 | 95119-95418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | IMGT000043 | 95827-96227 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | IMGT000043 | 98574-98710 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | IMGT000043 | 99573-99578 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM*02 | F | + | IGHM1 | CH1 | AY872256 | [1] | 93021..93318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AY872256 | [1] | 94474..94815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AY872256 | [1] | 95116..95418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | AY872256 | [1] | 95827..96227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | AY872256 | [1] | 98574..98710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | AY872256 | [1] | 99573..99578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM*03 | (F) | lambda RT15, IGHM1 | CH1 | X65262 | [2] | (3) | #c(s) | 382..519 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X65261 | [2] | (4) | #c(s) | 1..162 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | X65261 | [2] | #c(s) | 163..504 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | X65261 | [2] | (5) | #c(s) | 505..804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | X65261 | [2] | (5) | #c(s) | 805..1206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lambda RTtm, IGHM1 | M1 | X65263 | [2] | (5) | #c(m) | 356..493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | X65263 | [2] | #c(m) | 494..499 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM*04 | (F) | cRTVH50, IGHM1 | CH1 | S63348 | [3] | #c(s) | 403..699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | S63348 | [3] | #c(s) | 700..1041 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | S63348 | [3] | #c(s) | 1042..1341 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | S63348 | [3] | (5) | #c(s) | 1342..1743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM*05 | (F) | RBTIGTM2, IGHM1 | CH1 | U04615 | [4] | #c(m) | 403..699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | U04615 | [4] | #c(m) | 700..1041 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | U04615 | [4] | (5) | #c(m) | 1042..1344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | U04615 | [4] | (5) | #c(m) | 1345..1482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | U04615 | [4] | #c(m) | 1483..1488 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHM*06 | (F) | RBTIGTM1, IGHM1 | CH1 | U04616 | [4] | #c(m) | 406..702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | U04616 | [4] | #c(m) | 703..1044 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | U04616 | [4] | (5) | #c(m) | 1045..1347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | U04616 | [4] | (5) | #c(m) | 1348..1485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | U04616 | [4] | #c(m) | 1486..1491 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHMD | IGHMD*01 | F | Swanson | CM007946.1 | CH1 | IMGT000044 | 93022-93318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | IMGT000044 | 94474-94815 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | IMGT000044 | 95119-95418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | IMGT000044 | 95827-96227 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | IMGT000044 | 98574-98710 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | IMGT000044 | 99573-99578 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHMD*02 | F | gRTIgM, IGHM2 | CH1 | X83372 | [5] | (4) | 1..271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | X83372 | [5] | 1429..1770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | X83372 | [5] | 2074..2373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 (including CHS) | X83372 | [5] | (6) | 2785..3071 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD | IGHD*01 | p | (7) | CH1 | AY872256 | [1] | 100661..100999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2 | AY872256 | [1] | 101125..101424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH3 | AY872256 | [1] | 104153..104467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4 | AY872256 | [1] | 104627..104920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D | AY872256 | [1] | 105057..105356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P | (7) | CH3D | AY872257 | [1] | 844..1158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH4D | AY872257 | [1] | 1318..1611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH2D2 | AY872257 | [1] | 1748..2047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CH7 (including CHS) | AY872257 | [1] | 6737..7024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M1 | AY872257 | [1] | 7191..7342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M2 | AY872257 | [1] | 7739..7744 |
#c: rearranged cDNA.
(s) Trancript of a secreted chain.
(m) Trancript of a membrane chain.