"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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Pseudogenes which could not be assigned to subgroups with functional genes are designated by a roman number between parentheses, corresponding to the clans, followed by a dash and a number for the localization from 3' to 5' in the locus.
IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (V-REGION) |
Secondary accession numbers | Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (V-REGION) |
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IGLV(I)-24 | IGLV(I)-24*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <1004347..1004501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-24*02 | P | (1) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV2-6 | NW_001095158 | [1] | <2509964..2510118 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-28 | IGLV(I)-28*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <968996..969150 | 17573 | CM000296.1, IGLV2-4 | NW_001095158 | [1] | <2474025..2474179 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-31 | IGLV(I)-31*01 | P | (2) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <951373..>951482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-52 | IGLV(I)-52*01 | P | (3) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 818713..819002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-52*02 | P | (3) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV2-1 | NW_001095158 | [1] | 2324336..2324625 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-58 | IGLV(I)-58*01 | P | (2) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <669787..>670032 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-12 | NW_001095158 | [1] | <2174813..>2175058 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-61 | IGLV(I)-61*01 | P | (4) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 633063..633376 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-11 | NW_001095158 | [1] | 2138040..2138353 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-63 | IGLV(I)-63*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <629971..630186 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-10 | NW_001095158 | [1] | <2135028..2135243 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-68 | IGLV(I)-68*01 | P | (5) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 588263..588546 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-9 | NW_001095158 | [1] | 2093356..2093639 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-70 | IGLV(I)-70*01 | P | (6) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <578111..578354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-70*02 | P | (7) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-8 | NW_001095158 | [1] | <2083200..2083443 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-73 | IGLV(I)-73*01 | P | (8) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 559284..559598 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-7 | NW_001095158 | [1] | 2064358..2064672 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-75 | IGLV(I)-75*01 | P | (6) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <552433..552676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-78 | IGLV(I)-78*01 | P | (9) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 537752..538066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-78*02 | P | (9) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-6 | NW_001095158 | [1] | 2042783..2043097 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-82 | IGLV(I)-82*01 | P | (9) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 519465..519780 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-5 | NW_001095158 | [1] | 2024262..2024577 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-5 | AC214063 | [3] | (5033-5348)complement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-89 | IGLV(I)-89*01 | P | (10) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 470007..470299 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-4 | NW_001095158 | [1] | 1974814..1975106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-4 | AC214063 | [3] | (54504-54796)complement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-91 | IGLV(I)-91*01 | P | (11) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 444047..444338 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-3 | NW_001095158 | [1] | 1949283..1949574 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-3 | AC214063 | [3] | (80249-80540)complement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-107 | IGLV(I)-107*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <226885..227006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-107*02 | P | (1) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-2 | NW_001095158 | [1] | <1731832..1731953 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-118 | IGLV(I)-118*01 | P | (2) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <161242..>161430 | IGLV(I)-1 | AC215787 | [2] | <125484->125672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-118*02 | P | (2) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(I)-1 | NW_001095158 | [1] | <1666455..>1666643 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(I)-124 | IGLV(I)-124*01 | P | (12) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 37462..37745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-5 | IGLV(II)-5*01 | P | (11) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 1223454..1223741 | 17573 | CM000296.1, IGLV3-16 | NW_001095158 | [1] | 2735416..2735703 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-10 | IGLV(II)-10*01 | P | (15) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 1100210..1100485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-10*02 | P | (13) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(II)-2 | NW_001095158 | [1] | 2601523..2601798 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-21 | IGLV(II)-21*01 | P | (14) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 1023340..1023606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-21*02 | P | (14) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV3-7 | NW_001095158 | [1] | 2528979..2529245 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-50 | IGLV(II)-50*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <835954..836173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(II)-50*02 | P | (1) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(II)-1 | NW_001095158 | [1] | <2341640..2341859 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(III)-54 | IGLV(III)-54*01 | P | (7) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | <708387..708643 | 17573 | CM000296.1, IGLV(III)-4 | NW_001095158 | [1] | <2213366..2213622 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(III)-102 | IGLV(III)-102*01 | P | (8) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 254351..254660 | 17573 | CM000296.1, IGLV(III)-2 | NW_001095158 | [1] | 1759320..1759629 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(III)-116 | IGLV(III)-116*01 | P | (15) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 172458..172751 | IGLV(III)-1 | AC215787 | [1] | 136699-136992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(III)-116*02 | P | (15) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(III)-1 | NW_001095158 | [1] | 1677656..1677949 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-111 | IGLV(IV)-111*01 | P | (16) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 203695..204003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-111*02 | P | (16) | 10 | IGLV(IV)-3 | AC215787 | [2] | 167806..168113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-113 | IGLV(IV)-113*01 | P | (16) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 192632..192940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-113*02 | P | (16) | 10 | IGLV(IV)-2 | AC215787 | [2] | 156743..157051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-115 | IGLV(IV)-115*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 179936..>180025 | 17573 | CM000296.1, IGLV(V)-2 | NW_001095158 | [1] | 1685400..>1685489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(V)-2 | AC215787 | [2] | 144149..>144238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-121 | IGLV(IV)-121*01 | P | (17) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 84279..>84491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-127 | IGLV(IV)-127*01 | P | (11) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | complement(16001..16325) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(IV)-127*02 | P | (11) | 10 | 17573 | CM000296.1, IGLV(IV)-1 | NW_001095158 | [1] | complement(1555899..1556223) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGLV(V)-126 | IGLV(V)-126*01 | P | (1) | 10 | AG07107 | CM014345.1 | IMGT000062 | MAP | 25328..>25519 | 17573 | CM000296.1, IGLV(V)-1 | NW_001095158 | [1] | 1565501..>1565692 |
MAP: Mapped reference sequences.