IMGT Repertoire (IG and TR)
Gene table: Rhesus monkey (Macaca mulatta) TRBV
- Fct: FUNCTIONALITY
- F: Functional
- P: Pseudogene
- ORF: Open Reading Frame
- R: Rearranged
- T: Transcribed
- Pr: Translated into protein
"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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- IMGT gene name to get the corresponding IMGT/GENE-DB entry,
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| IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV1 | TRBV1-1 | TRBV1-1*01 | P | (1) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 94437..94925 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 10001..10489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV1-1*02 | P | (1) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 10001..10490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV1-2 | TRBV1-2*01 | P | (2) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 114272..114759 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 29836..30323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV1-3 | TRBV1-3*01 | P | (2) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 130356..130842 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 45920..46406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV1-3*02 | P | (2) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 45926..46412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV2 | TRBV2-1 | TRBV2-1*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 96280..96751 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 11844..12315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV2-1*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 11846..12317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV2-2 | TRBV2-2*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 116110..116584 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 31674..32148 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV2-3 | TRBV2-3*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 132214..132688 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 47778..48252 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV2-3*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 47783..48258 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3 | TRBV3-1 | TRBV3-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 103220..103715 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 18784..19279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3-2 | TRBV3-2*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 123677..124175 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 39241..39739 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3-2*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 39247..39745 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3-3 | TRBV3-3*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 138708..139203 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 54272..54767 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3-3*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 54266..54761 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3-4 | TRBV3-4*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 176551..177046 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 92143..92638 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV3-4*02 | F | 3 | + | + | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 91518..92013 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4 | TRBV4-1 | TRBV4-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 107867..108359 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 23431..23923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4-1*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 23432..23924 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4-2 | TRBV4-2*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 143048..143540 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 58643..59135 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4-2*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 58634..59126 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4-3 | TRBV4-3*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 179978..180479 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4-3*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 95570..96071 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV4-3*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 94945..95446 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5 | TRBV5-1 | TRBV5-1*01 | P | (3) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 153819..154326 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-1*02 | P | (3) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 69585..70092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-1*03 | P | (3) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 69560..70067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-2 | TRBV5-2*01 | P | (4) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 183332..183843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-2*02 | P | (4) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 98924..99435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-3 | TRBV5-3*01 | ORF | (5) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 226050..226557 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-3*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 141694..142201 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-3*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 140659..141166 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-4 | TRBV5-4*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 299507..300012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-4*02 | P | (6) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 215111..215616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-4*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 213708..214213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-5 | TRBV5-5*01 | P | (7) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 321417..321923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-5*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 237020..237525 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-5*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 235625..236130 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-6 | TRBV5-6*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 337415..337919 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 255579..256083 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-6*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 254215..254720 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-7 | TRBV5-7*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 353415..353919 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 272195..272699 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-7*02 | P | (7) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 270841..271343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-8 | TRBV5-8*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 385302..385807 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 301237..301742 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-8*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 305163..305668 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-9 | TRBV5-9*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 405129..405633 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-9*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 321063..321567 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-9*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 324989..325493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-10 | TRBV5-10*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 424157..424662 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 341430..341935 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV5-10*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 345317..345822 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6 | TRBV6-1 | TRBV6-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 161788..162258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-1*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 77552..78022 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-2 | TRBV6-2*01 | F | (8) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 191927..192213 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-2*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 107345..107816 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-2*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 106724..107195 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-2-1 | TRBV6-2-1*01 | ORF | (9) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 110146..>110399 | (25) | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 194582..>194600 | (25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-2-1*02 | P | (6) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 109379..109850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-3 | TRBV6-3*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 287289..287763 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-3*02 | F | 3 | + | + | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 202995..203469 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-4 | TRBV6-4*01 | ORF | (10) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 304826..305297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-4*02 | P | (1) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 220431..220901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-4*03 | P | (6) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 219029..219500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-5 | TRBV6-5*01 | ORF | (11) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 240358..240829 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 324914..325191 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-5-1 | TRBV6-5-1*01 | P | (12) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 344875..345165 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-5-1*02 | P | (13) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 262893..263368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-6 | TRBV6-6*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 359496..359964 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 278275..278743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-6*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 282611..283079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-7 | TRBV6-7*01 | ORF | (14) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 392771..393242 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 308706..309177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-8 | TRBV6-8*01 | ORF | (11) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 328384..328855 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 328384..328855 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV6-8*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 332190..332661 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7 | TRBV7-1 | TRBV7-1*01 | P | (15) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 81379..81926 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | (8) | 166000..166289 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-2 | TRBV7-2*01 | P | (7) | 3 | 17573 | CM002984.2, TRBV7-2*02 | IMGT000012 | 113728..114265 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 198735..198955 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-2*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 113048..113584 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-3 | TRBV7-3*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 221017..221516 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 136332..136831 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-4 | TRBV7-4*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 291451..291999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-4*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 207156..207704 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-4*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 205816..206360 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-5 | TRBV7-5*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 310934..311458 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 226537..227061 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-5*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 225138..225662 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-6 | TRBV7-6*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 326773..327288 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 244937..245452 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-6*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 243563..244079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-7 | TRBV7-7*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 348346..348854 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 267133..267637 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-7*02 | ORF | (16) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 265774..266278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-7-1 | TRBV7-7-1*01 | P | (13) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 292777..293283 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 377167..377309 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-7-1*02 | F | 3 | + | + | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 296677..297211 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-8 | TRBV7-8*01 | P | (13) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 397143..397668 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 313077..313602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-9 | TRBV7-9*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 416640..417177 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 332626..333163 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-9*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 336430..336973 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-10 | TRBV7-10*01 | ORF | (17) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 434885..435398 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 353456..353969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV7-10*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 356039..356548 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV8 | TRBV8-1 | TRBV8-1*01 | P | (18) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 204510..204788 | (25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV8-1*02 | P | (18) | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 119781..120059 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV8-2 | TRBV8-2*01 | P | (13) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 222815..223325 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 138459..138969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV8-2*02 | P | (13) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 125504..139296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV9 | TRBV9 | TRBV9*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 228727..229240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV9*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 144371..144884 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV9*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 143336..143849 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV10 | TRBV10-1 | TRBV10-1*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 237059..237547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV10-1*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 152725..153213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV10-2 | TRBV10-2*01 | F | (26) | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 261008..261496 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 176715..177203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV10-3 | TRBV10-3*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 449027..449515 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV10-3*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 367528..368016 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV11 | TRBV11-1 | TRBV11-1*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 248420..248908 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 164134..164622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV11-2 | TRBV11-2*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 270177..270656 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 185884..186363 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV11-2*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 184545..185024 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV11-3 | TRBV11-3*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 460081..460557 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 378585..379061 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12 | TRBV12-1 | TRBV12-1*01 | ORF | (19) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 277071..277552 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 192777..193258 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-1*02 | ORF | (19) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 191439..191920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-2 | TRBV12-2*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 465673..466158 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-2*02 | F | 3 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 384177..384662 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-2*03 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 386633..387118 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-3 | TRBV12-3*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 468941..469426 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 387443..387928 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-3*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 389899..390384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-4 | TRBV12-4*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 484283..484768 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 402783..403268 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV12-4*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 405237..405722 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV13 | TRBV13 | TRBV13*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 441689..442211 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 360260..360782 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV13*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 362794..363316 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV14 | TRBV14 | TRBV14*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 491273..491754 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 409794..410275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV15 | TRBV15 | TRBV15*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 496898..497405 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 415383..415890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV16 | TRBV16 | TRBV16*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 502794..503286 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 421279..421771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV16*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 422979..423471 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV18 | TRBV18 | TRBV18*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 517257..517914 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 435742..436399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV19 | TRBV19 | TRBV19*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 520617..521132 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 439121..439636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV19*02 | F | 3 | + | + | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 440824..441339 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV20 | TRBV20-1 | TRBV20-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 528381..529084 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 446885..447588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV20-1*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 448591..449294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21 | TRBV21-1 | TRBV21-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 538922..539416 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 457483..457977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV21-1*02 | F | 3 | + | + | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 458903..459400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV22 | TRBV22-1 | TRBV22-1*01 | P | (20) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 543773..544191 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 462334..462752 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV22-1*02 | P | (21) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 463740..464158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV23 | TRBV23-1 | TRBV23-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 547876..548397 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 466437..466958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV24 | TRBV24-1 | TRBV24-1*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 559882..560398 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 478580..479096 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV25 | TRBV25-1 | TRBV25-1*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 567721..568227 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 486419..486925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV26 | TRBV26 | TRBV26*01 | P | (7) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 588533..589055 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 507270..507792 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV26*02 | P | (7) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 508331..508853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV27 | TRBV27 | TRBV27*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 608615..609126 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 527352..527863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV27*02 | F | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 528402..528913 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV28 | TRBV28 | TRBV28*01 | F | 3 | + | + | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 613937..614459 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 532675..533197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV29 | TRBV29-1 | TRBV29-1*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 627622..628282 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 552292..552952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV29-1*02 | F | 3 | + | + | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | 553437..554097 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBV30 | TRBV30 | TRBV30*01 | F | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | complement(804383..805125) | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | complement(725092..725834) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBVA | TRBVA | TRBVA*01 | P | (22) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 575126..575619 | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 493840..494333 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBVB | TRBVB | TRBVB*01 | P | (23) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | 604823..>605116 | (25) | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | 523560..>523853 | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBVC | TRBVC | TRBVC*01 | P | (24) | 3 | 17573 | CM000289.1 | NW_001114291 | [1] | complement(<610133..610214) | (25) | 17573 | CM002984.2 | IMGT000012 | complement(<528870..528953) | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRBVC*02 | P | (24) | 3 | AG07107 | CM014338.1 | IMGT000073 | complement(529920..>530003) | (25) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT notes:
- (1) frameshift in L-PART1.
- (2) frameshift in L-PART1 and frameshifts in V-REGION.
- (3) No INIT-CODON.
- (4) No INIT-CODON and STOP-CODON in V-REGION.
- (5) No 1st-CYS.
- (6) STOP-CODON in V-REGION.
- (7) frameshift in V-REGION.
- (8) functionality defined for the available sequence of the gene (partial gene in 5' because of gaps in the sequence).
- (9) functionality defined as ORF because partial gene in 3'.
- (10) noncanonical V-HEPTAMER.
- (11) noncanonical V-NONAMER.
- (12) frameshifts in V-REGION, no V-RS.
- (13) frameshifts in V-REGION.
- (14) noncanonical DONOR-SPLICE and noncanonical V-NONAMER.
- (15) frameshift in L-PART2, several STOP-CODON in V-REGION, no CONSERVED-TRP
- (16) no 2nd-CYS.
- (17) unexpected V-SPACER length.
- (18) no L-PART1, frameshifts in V-REGION.
- (19) noncanonical DONOR-SPLICE, noncanonical V-HEPTAMER and noncanonical V-NONAMER.
- (20) no INIT-CODON, frameshifts in L-PART1.
- (21) no INIT-CODON, frameshifts in L-PART1, STOP-CODON in V-REGION.
- (22) no INIT-CODON, frameshift in L-PART1 and frameshifts in V-REGION.
- (23) no INIT-CODON, frameshift in L-PART1, frameshifts in V-REGION and no V-RS.
- (24) truncated and degenerated pseudogene.
- (25) Positions of V-REGION.
- (26) noncanonical V-NONAMER : tcataaagg instead of tcacaaacc, however this V-GENE has been found rearranged.
IMGT references:
- [1] Gibbs, R.A. et al., Science. 316(5822):222-234 (2007). PMID:17431167
More information:
See also (IMGT Scientific chart):
- Created:
- 05/10/2018
- Last updated:
- 22/09/2023
- Authors:
- Morgane Bertignac
