"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
Click on:
IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1 | IGKV1-5 | IGKV1-5*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 729301..729806 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-8 | IGKV1-8*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 679937..680458 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-9 | IGKV1-9*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 666630..667136 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-10 | IGKV1-10*01 | P | (1) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 645422..645925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-13 | IGKV1-13*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 604993..605498 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-14 | IGKV1-14*01 | P | (2) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 586087..586595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-16 | IGKV1-16*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 558958..559463 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-17 | IGKV1-17*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 542837..543342 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-18 | IGKV1-18*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 525232..525737 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-19 | IGKV1-19*01 | ORF | (3) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 505430..505926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-22 | IGKV1-22*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 478248..478752 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-23 | IGKV1-23*01 | ORF | (4) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 464180..464679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-24 | IGKV1-24*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 458411..458916 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-27 | IGKV1-27*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 404256..404761 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-28 | IGKV1-28*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 386795..387300 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-31 | IGKV1-31*01 | P | (5) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 356445..356953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-35 | IGKV1-35*01 | P | (6) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 312031..312526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-41 | IGKV1-41*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 274268..274774 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-47 | IGKV1-47*01 | P | (7) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 232720..233012 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-48 | IGKV1-48*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 221348..221852 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-52 | IGKV1-52*01 | ORF | (8) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 191557..192060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-54 | IGKV1-54*01 | P | (9) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 172931..173429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-58 | IGKV1-58*01 | P | (10) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 146363..146867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-65 | IGKV1-65*01 | P | (11) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(62619..63119) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-67 | IGKV1-67*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(46322..46820) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-70 | IGKV1-70*01 | P | (12) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(21377..21872) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2 | IGKV2-4 | IGKV2-4*01 | P | (9) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 738912..739670 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-11 | IGKV2-11*01 | P | (13) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 628732..>629032 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-20 | IGKV2-20*01 | P | (14) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 494865..495622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-25 | IGKV2-25*01 | P | (15) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 425839..426632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-32 | IGKV2-32*01 | P | (16) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <350934..351192 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-36 | IGKV2-36*01 | P | (17) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 310202..311236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-38 | IGKV2-38*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 291335..292113 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-39 | IGKV2-39*01 | P | (18) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <284271..284565 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-43 | IGKV2-43*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 265711..266474 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-44 | IGKV2-44*01 | P | (9) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 253287..254044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-45 | IGKV2-45*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 242639..243457 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-49 | IGKV2-49*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 206154..206914 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-50 | IGKV2-50*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 199298..200153 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-53 | IGKV2-53*01 | P | (19) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 186596..187383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-55 | IGKV2-55*01 | P | (20) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 163183..163950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-56 | IGKV2-56*01 | P | (21) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 155243..156012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-61 | IGKV2-61*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 126717..127463 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-63 | IGKV2-63*01 | P | (22) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(<75274..75484) | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-64 | IGKV2-64*01 | P | (23) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(68568..68869) | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-66 | IGKV2-66*01 | P | (24) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(56087..56835) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3 | IGKV3-7 | IGKV3-7*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 703593..704136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-12 | IGKV3-12*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 620290..620823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-15 | IGKV3-15*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 573619..574168 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-21 | IGKV3-21*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 491149..491692 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-26 | IGKV3-26*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 418946..419488 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-33 | IGKV3-33*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 343094..343655 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-37 | IGKV3-37*01 | P | (25) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 295372..295631 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-46 | IGKV3-46*01 | P | (26) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 236232..236799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-51 | IGKV3-51*01 | P | (27) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <194749..>195020 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-57 | IGKV3-57*01 | P | (28) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 149553..>149803 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-69 | IGKV3-69*01 | P | (29) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(29548..30119) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV4 | IGKV4-1 | IGKV4-1*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(783769..784382) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV5 | IGKV5-2 | IGKV5-2*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(771927..772446) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV6 | IGKV6-6 | IGKV6-6*01 | P | (10) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 714740..715326 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV6-30 | IGKV6-30*01 | ORF | (30) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 373665..374246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV6-34 | IGKV6-34*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 322939..323520 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV7 | IGKV7-3 | IGKV7-3*01 | F | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 753738..754370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV9 | IGKV9-62 | IGKV9-62*01 | ORF | (31) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(82838..83738) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV9-68 | IGKV9-68*01 | P | (32) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(<34921..>35177) | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV9-71 | IGKV9-71*01 | P | (32) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(<9973..>10229) | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II) | IGKV(II)-5-1 | IGKV(II)-5-1*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <721369..>721597 | (36) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-13-1 | IGKV(II)-13-1*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <596257..>596485 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-14-1 | IGKV(II)-14-1*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <581576..>581807 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-29 | IGKV(II)-29*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <378881..>379109 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-40 | IGKV(II)-40*01 | P | (34) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <279763..279959 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-42 | IGKV(II)-42*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <268606..>268826 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-43-1 | IGKV(II)-43-1*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <257505..>257738 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-54-1 | IGKV(II)-54-1*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <167921..>168127 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-59 | IGKV(II)-59*01 | P | (35) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | 136312..>136526 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-60 | IGKV(II)-60*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | <131060..>131266 | (36) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV(II)-61-1 | IGKV(II)-61-1*01 | P | (33) | 2A | Susie | NC_036904.1 | IMGT000096 | MAP | complement(<87943..>88230) | (36) |