"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
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IGKV1 | IGKV1-5 | IGKV1-5*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 795342..795847 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-5*02 | P | (1) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 598955..599454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-6 | IGKV1-6*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 776367..776873 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 580025..580531 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-8 | IGKV1-8*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 749968..750473 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 553668..554173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-12 | IGKV1-12*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 682280..682784 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 485983..486487 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-13 | IGKV1-13*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 676516..677025 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-13*02 | F | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 480198..480707 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-17 | IGKV1-17*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 622529..623034 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 426112..426617 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-22 | IGKV1-22*01 | P | (3) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 550099..550592 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 353667..354160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-32 | IGKV1-32*01 | P | (4) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 141831..142325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-32*02 | P | (4) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 141372..141866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-33 | IGKV1-33*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 127661..128165 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 127239..127743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-35 | IGKV1-35*01 | P | (5) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 106560..107063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-35*02 | P | (5) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 106144..106647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-37 | IGKV1-37*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 95988..96496 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 95560..96068 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-39 | IGKV1-39*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 77376..77880 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 76958..77462 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-42 | IGKV1-42*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 712577..713073 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-42*02 | P | (29) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 516234..516729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-43 | IGKV1-43*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 732408..732913 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-43*02 | F | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 536075..536580 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-44 | IGKV1-44*01 | ORF | (6) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 49193..49693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-44*02 | P | (7) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 49096..49599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-49 | IGKV1-49*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 9811..10315 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV1-49*02 | F | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 9811..10315 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2 | IGKV2-4 | IGKV2-4*01 | P | (8) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 810764..811521 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-4*02 | P | (9) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 616079..616835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-10 | IGKV2-10*01 | P | (10) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 702264..703057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-10*02 | P | (11) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 505943..506734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-14 | IGKV2-14*01 | P | (12) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 644101..644888 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 447681..448465 | (13) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-18 | IGKV2-18*01 | P | (14) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 593102..593908 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 396679..397485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-19 | IGKV2-19*01 | P | (15) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | <587335..587575 | (16) | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | <390912..391152 | (16) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-23 | IGKV2-23*01 | P | (17) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 548772..>548972 | (16) | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 352340..>352540 | (16) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-24 | IGKV2-24*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 544205..545024 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 347772..348591 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-29 | IGKV2-29*01 | P | (18) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 160850..161596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-30 | IGKV2-30*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 150277..151088 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-36 | IGKV2-36*01 | P | (19) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | <98287..>98508 | (16) | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | <97874..>98095 | (16) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-38 | IGKV2-38*01 | P | (20) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 87329..87630 | (16) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-38*02 | P | (20) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 86905..87206 | (16) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-40 | IGKV2-40*01 | P | (21) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 66644..67406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-40*02 | F | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 66244..67008 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-45 | IGKV2-45*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 38854..39710 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-45*02 | P | (22) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 38831..39683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-46 | IGKV2-46*01 | ORF | (23) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 26685..27451 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 26676..27442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV2-47 | IGKV2-47*01 | P | (24) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 18724..19493 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 18720..19489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3 | IGKV3-7 | IGKV3-7*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 763879..764422 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 567549..568091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-11 | IGKV3-11*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 695285..695828 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 498969..499511 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-15 | IGKV3-15*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 637151..637694 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-15*02 | F | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 440735..441278 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-20 | IGKV3-20*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 579480..580044 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 383058..383622 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-31 | IGKV3-31*01 | P | (25) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 143111..143678 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 142652..143219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-34 | IGKV3-34*01 | P | (26) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 117932..118480 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 117519..118067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-48 | IGKV3-48*01 | P | (27) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 12769..13331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV3-48*02 | P | (27) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 12762..13322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV4 | IGKV4-1 | IGKV4-1*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | complement(853845..854457) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV4-1*02 | P | (28) | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | complement(659137..659748) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV5 | IGKV5-2 | IGKV5-2*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | complement(842142..842661) | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | complement(647448..647967) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV6 | IGKV6-21 | IGK6-21*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 560929..561510 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 364499..365080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV6-41 | IGKV6-41*01 | ORF | (2) | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 610604..611185 | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 414187..414768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV7 | IGKV7-3 | IGKV7-3*01 | F | 2A | Kamilah | CM017848.1 | IMGT000077 | MAP | 824244..824873 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGKV7-3*02 | F | 2A | LT578338.1 | IMGT000089 | MAP | 629552..630181 |