IMGT Repertoire (IG and TR)
Gene table: Western lowland gorilla (Gorilla gorilla gorilla) IGLV
- Fct: FUNCTIONALITY
- F: Functional
- P: Pseudogene
- ORF: Open Reading Frame
- R: Rearranged
- T: Transcribed
- Pr: Translated into protein
"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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- IMGT gene name to get the corresponding IMGT/GENE-DB entry,
- IMGT allele name to see the corresponding Alignments of alleles,
- accession number to get the corresponding IMGT/LIGM-DB entry.
| IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Isolate | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (L-V-GENE-UNIT) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1 | IGLV1-44 | IGLV1-44*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 338419..338925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-44*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 356447..356953 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 356447..356953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-44*03 | F | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 345979..346485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-47 | IGLV1-47*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 309310..309816 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-47*02 | P | (1) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 327405..327909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-47*03 | F | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 316937..317443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-47*04 | F | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 316614..317120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-50 | IGLV1-50*01 | ORF | (2) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 279270..279774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-50*02 | ORF | (2) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 297356..297860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-50*03 | ORF | (2) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 286817..287321 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-50*04 | P | (32) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 286559..287062 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-51 | IGLV1-51*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 273413..273913 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-51*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 291505..292005 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 280961..281461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 280709..281209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-62 | IGLV1-62*01 | P | (3) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 33707..34209 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 33707..34209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 40487..40989 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 40511..41013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-67-1 | IGLV1-67-1*01 | P | (3) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 22143..22625 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 22143..22625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 28924..29406 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV1-67-1*02 | P | (3) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 28938..29420 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2 | IGLV2-5 | IGLV2-5*01 | P | (3) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 762361..762871 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-5*02 | P | (3) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 800555..801065 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 750415..750925 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-5*03 | P | (33) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 790558..791072 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-8 | IGLV2-8*01 | ORF | (4) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 728993..729500 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 717018..717525 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 757118..757625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-8*02 | ORF | (4) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 767133..767640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-11 | IGLV2-11*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 698604..699113 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 736761..737270 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 686630..687139 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 726735..727244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-14 | IGLV2-14*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 665047..665556 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 703226..703735 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 653064..653573 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-14*02 | F | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 693200..693706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-18 | IGLV2-18*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 641011..641520 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 629015..629524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-18*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 679198..679707 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-18*03 | F | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 669107..669616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-23 | IGLV2-23*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 602298..602806 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 640481..640989 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 590289..590797 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 630398..630906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-24-4 | IGLV2-24-4*01 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 622997..623504 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 612888..613395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-28 | IGLV2-28*01 | P | (31) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 569069..569353 | (11) | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 596034..596318 | (11) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 585863..586147 | (11) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-28*02 | P | (31) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 575503..575787 | (11) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-33 | IGLV2-33*01 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 518869..519383 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 590289..590797 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-23 | IGLV2-23*02 | F | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 630398..630906 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-34 | IGLV2-34*01 | P | (3) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 510698..511206 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 500421..500929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV2-34*02 | P | (3) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 500809..501317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3 | IGLV3-1 | IGLV3-1*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 786442..787117 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 774522..775197 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-1*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 824629..825301 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 814617..815292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-2 | IGLV3-2*01 | P | (5) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 778786..779309 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 816980..817503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 766868..767391 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 806962..807485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-4 | IGLV3-4*01 | ORF | (6) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 763593..764113 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 801787..802307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 751647..752167 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 791794..792314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-6 | IGLV3-6*01 | P | (7) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 755946..756471 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 794140..794665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 784143..784668 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-6*02 | P | (7) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 743998..744523 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-7 | IGLV3-7*01 | P | (8) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 744206..744716 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 782392..782902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-7*02 | P | (8) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 732235..732769 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 772379..772913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-9 | IGLV3-9*01 | P | (30) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 725307..725973 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 713332..713998 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-9*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 763449..764115 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 753432..754098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-10 | IGLV3-10*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 717951..718489 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 705976..706514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 746075..746613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-10*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 756102..756640 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-12 | IGLV3-12*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 677961..678756 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 716135..716930 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 665976..666771 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 706093..706887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-13 | IGLV3-13*01 | P | (9) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 668202..668735 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 656217..656750 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-13*02 | P | (9) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 706377..706910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-13*03 | F | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 696349..696882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-15 | IGLV3-15*01 | P | (5) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 661549..662217 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 699728..700396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 649566..650234 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-15*02 | P | (5) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 689705..690373 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-16 | IGLV3-16*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 653797..654335 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 691974..692511 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 641809..642347 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 681908..682446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-17 | IGLV3-17*01 | P | (10) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 645112..645627 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 683294..683809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 633111..633626 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-17*02 | P | (10) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 673208..673723 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-19 | IGLV3-19*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 624976..625507 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 663169..663700 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 612987..613518 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 653087..653618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-21 | IGLV3-21*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 616780..617591 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-21*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 655112..655769 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 604924..605590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 645033..645687 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-22 | IGLV3-22*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 608682..609214 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 646863..647395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 596673..597205 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 636782..637314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-24 | IGLV3-24*01 | P | (5) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 598955..599471 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 586946..587462 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-24*02 | P | (5) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 637138..637654 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 627055..627571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-24-2 | IGLV3-24-2*01 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 629356..629883 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 619248..619775 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-24-2*02 | F | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 579178..579705 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-25 | IGLV3-25*01 | ORF | (12) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 591154..591705 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-25*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 617967..618518 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 607877..608428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-26 | IGLV3-26*01 | P | (13) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 577569..578093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-26*02 | P | (13) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 604533..605057 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 594362..594886 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-27 | IGLV3-27*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 572744..573265 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-27*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 599708..600229 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 589537..590058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-29 | IGLV3-29*01 | P | (14) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 565372..566039 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 592338..593005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-29*02 | P | (14) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 571950..572464 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 582310..582824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-30 | IGLV3-30*01 | P | (15) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 549252..549784 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 528105..528637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 539056..539588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-31 | IGLV3-31*01 | P | (3) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 535369..535900 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 525094..525625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-32 | IGLV3-32*01 | ORF | (16) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 525238..525766 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 514961..515489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV3-32*02 | ORF | (16) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 515354..515882 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4 | IGLV4-3 | IGLV4-3*01 | ORF | (17) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 777319..777853 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 805495..806029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-3*02 | ORF | (17) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 815506..816040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-3*03 | ORF | (17) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 765401..765935 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-7-1 | IGLV4-7-1*01 | P | (18) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 740524..741061 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 768694..769231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-7-1*02 | P | (18) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 778711..779248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-7-1*03 | P | (18) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 728548..729085 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-10-1 | IGLV4-10-1*01 | P | (19) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 708966..709499 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 747125..747658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-10-1*02 | P | (19) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 696997..697530 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-10-1*03 | P | (19) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 737096..737629 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-60 | IGLV4-60*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 112036..112560 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 112004..112528 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 118841..119365 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 118845..119369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-69 | IGLV4-69*01 | P | (20) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 14688..15205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-69*02 | P | (20) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 14688..15205 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 21469..21986 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV4-69*03 | P | (20) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 21483..22000 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5 | IGLV5-45 | IGLV5-45*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 333566..334096 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 351605..352135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 341127..341657 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 340870..341400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5-48 | IGLV5-48*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 304491..305022 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 312103..312634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 311796..312327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5-48*02 | P | (21) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 322583..323110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5-52 | IGLV5-52*01 | ORF | (22) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 269634..270167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5-52*02 | P | (1) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 287752..288278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5-52*03 | ORF | (22) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 277187..277720 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV5-52*04 | P | (21) | 22 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 276950..277479 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV6 | IGLV6-57 | IGLV6-57*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 145638..146154 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 145587..146103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 152447..152963 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 152410..152926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV7 | IGLV7-35 | IGLV7-35*01 | P | (23) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 362895..363384 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 371039..371528 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 370588..371077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV7-35*02 | P | (24) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 381182..381670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV7-43 | IGLV7-43*01 | ORF | (25) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 354741..355220 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 362887..363366 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 362423..362902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV7-43*02 | ORF | (25) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 373024..373503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV7-46 | IGLV7-46*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 327202..327679 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 345247..345724 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 334766..335243 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 334506..334983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV8 | IGLV8-61 | IGLV8-61*01 | F | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 45890..46381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV8-61*02 | F | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 45890..46381 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 52675..53166 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 52700..53191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV9 | IGLV9-49 | IGLV9-49*01 | F | (26) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 294766..295314 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 312854..313402 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 302061..302609 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV9-49*02 | F | (26) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 302308..302856 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV10 | IGLV10-54 | IGLV10-54*01 | ORF | (27) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 164559..165062 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 164500..165003 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 171355..171858 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 171316..171819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV10-67 | IGLV10-67*01 | P | (28) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 26974..27474 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 26980..27474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 33761..34261 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 33773..34273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV11 | IGLV11-55 | IGLV11-55*01 | ORF | (29) | 22 | Kamilah | CM017869.1 | IMGT000086 | MAP | 151516..152037 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV11-55*02 | ORF | (29) | 22 | LT578337.1 | IMGT000094 | MAP | 151464..151985 | KB3781 | CM054580.1 | IMGT000153 | MAP | 158289..158810 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IGLV11-55*03 | ORF | (29) | 22 | KB3781 | CM054604.1 | IMGT000152 | MAP | 158326..158847 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT notes:
- (1) frameshifts in V-REGION: several deletions
- (2) noncanonical V-NONAMER: agaagaacc instead of acacaaacc
- (3) several STOP-CODON in V-REGION
- (4) noncanonical V-NONAMER: atcaaaacc instead of acacaaacc
- (5) frameshift in L-PART1 causing defectuous DONOR-SPLICE, frameshifts in V-REGION: several deletions
- (6) no 2nd-CYS: Phe instead of Cys
- (7) no ACCEPTOR-SPLICE, STOP-CODON in V-REGION: position 25, frameshifts in V-REGION: several deletions
- (8) frameshift in L-PART1 causing defectuous DONOR-SPLICE, frameshift in V-REGION: insertion of 2 nt in FR2-IMGT
- (9) STOP-CODON in V-REGION: position 109
- (10) frameshift in L-PART1 causing defectuous DONOR-SPLICE, no INIT-CODON: Val instead of Met, no DONOR-SPLICE, frameshifts in V-REGION: several deletions
- (11) position of V-REGION
- (12) no 1st-CYS in FR1-IMGT: Ser instead of Cys
- (13) no INIT-CODON: Val instead of Met, frameshift in V-REGION: deletion of 1 nt in FR3-IMGT
- (14) STOP-CODON in V-REGION: position 40, frameshift in V-REGION: deletion of 5 nt in FR3-IMGT
- (15) STOP-CODON in V-REGION: position 75, frameshift in V-REGION: deletion of 4 nt in FR3-IMGT
- (16) noncanonical ACCEPTOR-SPLICE: nggnn instead of nagnn, no 2nd-CYS: Tyr instead of Cys
- (17) noncanonical V-NONAMER: gccaaaacc instead of acacaaacc, STOP-CODON at position 116 (last 3' codon of germline CDR3-IMGT) may disappear during rearrangements
- (18) no INIT-CODON: Lys instead of Met, several STOP-CODON in V-REGION
- (19) no INIT-CODON: Gly instead of Met, frameshift in L-PART1 causing defectuous DONOR-SPLICE, several STOP-CODON in V-REGION, no CONSERVED-TRP: STOP-CODON instead of Trp
- (20) no INIT-CODON: Val instead of Met
- (21) frameshift in V-REGION: deletion of 4 nt in FR3-IMGT
- (22) noncanonical ACCEPTOR-SPLICE: nggnn instead of nagnn
- (23) frameshift in V-REGION: insertion of 1 nt in FR3-IMGT
- (24) frameshift in V-REGION: deletion of 1 nt in CDR1-IMGT, insertion of 1 nt in FR3-IMGT
- (25) no CONSERVED-TRP: Arg instead of Trp
- (26) STOP-CODON at position 116 (last 3' codon of germline CDR3-IMGT) may disappear during rearrangements
- (27) noncanonical V-NONAMER: ataaaaact instead of acacaaacc
- (28) frameshift in V-REGION: deletion of 1 nt in FR3-IMGT
- (29) unexpected V-SPACER length: 19 nt instead of 23 nt
- (30) STOP-CODON in V-REGION: position 107
- (31) frameshifts in V-REGION: several deletions and insertions, no V-NONAMER
- (32) frameshift in V-REGION: deletion of 1 nt in CDR2-IMGT
- (33) frameshift in V-REGION: insertion of 4 nt in FR3-IMGT
More information:
See also (IMGT Scientific chart):
- Created:
- 26/09/2022
- Last updated:
- 22/09/2023
- Authors:
- Chahrazed Debbagh
