"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
Click on:
IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization |
R | T | Pr | IMGT/LIGM-DB locus reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (J-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Breed | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (J-GENE-UNIT) |
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TRAJ1 | TRAJ1*01 | P | (1) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 734935..735026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ2 | TRAJ2*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 733761..733840 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ3 | TRAJ3*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 733218..733303 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ4 | TRAJ4*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 732243..732333 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ5 | TRAJ5*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 729402..729489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ6 | TRAJ6*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 727996..728085 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ7 | TRAJ7*01 | ORF | (2) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 726262..726348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ8 | TRAJ8*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 724689..724776 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ9 | TRAJ9*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 724106..724188 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ10 | TRAJ10*01 | ORF | (3) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 722193..722283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ11 | TRAJ11*01 | ORF | (4) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 721186..721273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ12 | TRAJ12*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 720608..720695 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ13 | TRAJ13*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 719767..719855 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ14 | TRAJ14*01 | P | (5) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 718566..718651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ15 | TRAJ15*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 717818..717905 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ16 | TRAJ16*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 716669..716756 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ17 | TRAJ17*01 | P | (1) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 715280..715366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ18 | TRAJ18*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 714143..714236 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ19 | TRAJ19*01 | ORF | (6) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 713752..713835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ20 | TRAJ20*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 712772..712856 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ21 | TRAJ21*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 712041..712123 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ22 | TRAJ22*01 | ORF | (7) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 710283..710368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ23 | TRAJ23*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 708653..708743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ24 | TRAJ24*01 | ORF | (8) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 708218..708309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ25 | TRAJ25*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 707357..707444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ26 | TRAJ26*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 707019..707106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ27 | TRAJ27*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 704856..704942 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ28 | TRAJ28*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 704213..704303 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ29 | TRAJ29*01 | P | (9) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 703168..703284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ30 | TRAJ30*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 702128..702214 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ31 | TRAJ31*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 700112..700196 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ32 | TRAJ32*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 698585..698676 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ33 | TRAJ33*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 697830..697914 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ34 | TRAJ34*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 697135..697220 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ35 | TRAJ35*01 | ORF | (10) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 696204..696297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ36 | TRAJ36*01 | P | (1) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 694680..694784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ37 | TRAJ37*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 693908..693997 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ38 | TRAJ38*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 692391..692480 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ39 | TRAJ39*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 691745..691835 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ40 | TRAJ40*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 689632..689720 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ41 | TRAJ41*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 687591..687680 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ42 | TRAJ42*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 687081..687174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ43 | TRAJ43*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 686253..686337 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ44 | TRAJ44*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 685158..685248 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ45 | TRAJ45*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 684046..684136 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ46 | TRAJ46*01 | ORF | (11) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 683533..683623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ47 | TRAJ47*01 | P | (1) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 682945..683042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ48 | TRAJ48*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 680957..681047 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ49 | TRAJ49*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 680151..680237 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ50 | TRAJ50*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 679313..679400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ52 | TRAJ52*01 | ORF | (12) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 676925..677021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ53 | TRAJ53*01 | ORF | (13) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 673958..674044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ54 | TRAJ54*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 673310..673402 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ56 | TRAJ56*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 670536..670625 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ57 | TRAJ57*01 | ORF | (14) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 669889..669979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ58 | TRAJ58*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 668669..668759 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ59 | TRAJ59*01 | ORF | (15) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 667521..667608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ60 | TRAJ60*01 | F | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 667278..667361 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRAJ61 | TRAJ61*01 | P | (1) | 8 | Boxer | CM000008.3 | IMGT000004 | [1] | 666264..666361 |