"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization | R | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (D-GENE-UNIT) |
Secondary accession numbers | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence (D-GENE-UNIT) |
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IGHD1 | IGHD1-1 | IGHD1-1*01 | F | 14q32.33 | 23599-35048 | D1-1 | X97051 | [8] | 33686-33758 | AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reverse-complement-of_ABC13_11_000049738900_M6 | IMGT000054 | [10] | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABC13_11_000049738900_M6 | AC279151 | [10] | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1-7 | IGHD1-7*01 | F | 14q32.33 | 43057-44649 | (6) | DM1 | X13972 | [5] | (1) | 5238-5310 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 43272-43344 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1-14 | IGHD1-14*01 | ORF | (3) | 14q32.33 | 52325-53909 | (6) | DM2 | X13972 | [5] | (1,2) | 14490-14562 | M37277 | [5] | (1,2) | X97051 | [8] | 52540-52612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1-20 | IGHD1-20*01 | F | 14q32.33 | 61770-63337 | D1-20 | X97051 | [8] | 61987-62059 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1-26 | IGHD1-26*01 | F | 14q32.33 | 71927-79765 | D1-26 | X97051 | [8] | 72141-72216 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2 | IGHD2-2 | IGHD2-2*01 | F | 14q32.33 | D4 | J00232 | [1] | 1-87 | Reverse-complement-of_ABC13_11_000049738900_M6 | IMGT000054 | [10] | (7) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABC13_11_000049738900_M6 | AC279151 | [10] | (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-2*02 | F | 14q32.33 | 35049-37615 | D2-2 | X97051 | [8] | 36339-36425 | AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-2*03 | F | 14q32.33 | D4 | M35648 | [3] | M35649 | [3] | 42-128 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-8 | IGHD2-8*01 | F | 14q32.33 | 44650-47262 | (6) | DLR1 | X13972 | [5] | (1) | 7921-8007 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 45954-46040 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M35650 | [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-8*02 | F | 14q32.33 | D1 | J00233 | [1] | 1-87 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-15 | IGHD2-15*01 | F | 14q32.33 | 53910-56408 | (6) | D2 | J00234 | [1] | 1-87 | X97051 | [8] | 55207-55293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-21 | IGHD2-21*01 | F | 14q32.33 | D3 | J00235 | [1] | 1-84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2-21*02 | F | 14q32.33 | 63338-65916 | D2-21 | X97051 | [8] | 64616-64699 | AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3 | IGHD3-3 | IGHD3-3*01 | F | 14q32.33 | 37616-39425 | (6) | DXP4 | X13972 | [5] | (1) | 776-862 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 38806-38892 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-3*02 | F | 14q32.33 | D23/7 | X93618 | [4] | 2-88 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-9 | IGHD3-9*01 | F | 14q32.33 | 47263-48619 | (6) | DXP1 | X13972 | [5] | (1) | 10447-10533 | M37277 | [5] | (1) | M37485 | [7] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D21/0.5 | X93613 | [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X97051 | [8] | 48484-48570 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-10 | IGHD3-10*01 | F | 14q32.33 | 48620-49158 | (6) | DXP'1 | X13972 | [5] | (1) | 10631-10717 | M37277 | [5] | (1) | M37485 | [7] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X97051 | [8] | 48668-48754 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-10*02 | F | 14q32.33 | D21/7 | X93615 | [4] | 2-87 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-16 | IGHD3-16*01 | F | 14q32.33 | D21/10 | X93614 | [4] | 2-94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-16*02 | F | 14q32.33 | 56409-58143 | X97051 | [9] | 57524-57616 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3-22 | IGHD3-22*01 | F | 14q32.33 | 65917-67762 | (6) | D21/9 | X93616 | [4] | 2-88 | X97051 | [8] | 67133-67219 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD4 | IGHD4-4 | IGHD4-4*01 | F | 14q32.33 | 39426-40474 | (6) | DA4 | X13972 | [5] | (1) | 1924-1995 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 39958-40029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD4-11 | IGHD4-11*01 | ORF | (4) | 14q32.33 | 49159-50078 | (6) | DA1 | X13972 | [5] | (1) | 11522-11593 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 49563-49634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD4-17 | IGHD4-17*01 | F | 14q32.33 | 58144-59187 | D4-17 | X97051 | [8] | 58671-58742 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD4-23 | IGHD4-23*01 | ORF | (4) | 14q32.33 | 67763-68826 | D4-23 | X97051 | [8] | 68306-68380 | AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD5 | IGHD5-5 | IGHD5-5*01 | F | 14q32.33 | 40475-41880 | (6) | DK4 | X13972 | [5] | (1) | 2885-2960 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 40919-40994 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD5-12 | IGHD5-12*01 | F | 14q32.33 | 50079-51316 | (6) | DK1 | X13972 | [5] | (1) | 12478-12556 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 50523-50601 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD5-18 | IGHD5-18*01 | F | 14q32.33 | 59188-60591 | D5-18 | X97051 | [8] | 59633-59708 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD5-24 | IGHD5-24*01 | ORF | (5) | 14q32.33 | 68827-70492 | D5-24 | X97051 | [8] | 69272-69347 | AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD6 | IGHD6-6 | IGHD6-6*01 | F | 14q32.33 | 41881-43056 | (6) | DN4 | X13972 | [5] | (1) | 4734-4807 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 42767-42840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD6-13 | IGHD6-13*01 | F | 14q32.33 | 51317-52324 | (6) | DN1 | X13972 | [5] | (1) | 13983-14059 | M37277 | [5] | (1) | X97051 | [8] | 52032-52108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AB019441 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD6-19 | IGHD6-19*01 | F | 14q32.33 | 60592-61769 | D6-19 | X97051 | [8] | 61475-61551 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD6-25 | IGHD6-25*01 | F | 14q32.33 | 70493-71926 | D6-25 | X97051 | [8] | 71638-71711 | AB019441 | [9] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD7 | IGHD7-27 | IGHD7-27*01 | F | 14q32.33 | 87428-87515 | (6) | DHQ52 | J00256 | [2] | 592-659 | X97051 | [8] | 87431-87497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X86355 | [6] | 154-220 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X86356 | [6] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X86357 | [6] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X86358 | [6] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X86359 | [6] |
c: cDNA sequence.
(s): Transcript of a secreted chain.
IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization | R | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | Secondary accession numbers | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1 | IGHD1/OR15-1a | IGHD1/OR15-1a*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DM5-a | X55575 | [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD1/OR15-1b | IGHD1/OR15-1b*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DM5-b | X55576 | [3] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2 | IGHD2/OR15-2a | IGHD2/OR15-2a*01 | ORF | 15 (15q11.2) | D5-a | X55577 | [3] | M35647 | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD2/OR15-2b | IGHD2/OR15-2b*01 | ORF | 15 (15q11.2) | D5-b | X55578 | [3] | M35647 | [1] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3 | IGHD3/OR15-3a | IGHD3/OR15-3a*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DXP5-a | X55579 | [3] | D22/12 | X93617 | [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD3/OR15-3b | IGHD3/OR15-3b*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DXP5-b | X55580 | [3] | D22/12 | X93617 | [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD4 | IGHD4/OR15-4a | IGHD4/OR15-4a*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DA5-a | X55581 | [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD4/OR15-4b | IGHD4/OR15-4b*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DA5-b | X55582 | [3] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD5 | IGHD5/OR15-5a | IGHD5/OR15-5a*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DK5-a | X55583 | [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IGHD5/OR15-5b | IGHD5/OR15-5b*01 | ORF | 15 (15q11.2) | DK5-b | X55584 | [3] |