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Gènes et locus (TR)

DOCUMENTS A CONSULTER :
  1. Localisation chromosomique des gènes des récepteurs T

    L'ensemble des gènes codant un type de chaîne de récepteurs T, à un endroit donné d'un chromosome, s'appelle un locus.

    • Quels sont les 4 locus chez l'homme ? Quelle est leur localisation chromosomique exacte ? (bras court du chromosome ? bras long ? position par rapport au centromère ? au télomère ?)
  2. Types et nombre de gènes

    Il existe 4 types de gènes : V (variable), D (diversité), J (jonction) et C (constant).

    • Quels sont les types de gènes trouvés :
      • dans les locus des chaînes alpha ?
      • dans les locus des chaînes beta ?
      • dans les locus des chaînes gamma ?
      • dans les locus des chaînes delta ?
    • Quel est le nombre total de gènes dans chaque locus ?
      Compléter le tableau suivant. Calculer le total minimal et maximal de gènes.
    V D J C Minimal Maximal
    TRA
    TRB
    TRG
    TRD
    • Qu'appelle-t-on un orphon ? Quelle est la fonctionnalité d'un orphon ? Combien y a-t-il d'orphons TR chez l'homme ?
    • Les gènes V, D et J peuvent exister sous 2 types de configuration : "germline" ou "réarrangé".
      Définir ces termes.
    • On distingue 3 fonctionnalités pour les gènes C, pour les gènes V, D et J en configuration "germline" : "fonctionnel", "ORF", "pseudogène".
      Définir ces termes.
    • Quel est le nombre de gènes fonctionnels dans chaque locus ?
      Compléter le tableau suivant. Calculer le nombre total et minimal de gènes fonctionnels.
    V D J C Minimal Maximal
    TRA
    TRB
    TRG
    TRD
    • Comparer le nombre de gènes fonctionnels avec le nombre total de gènes. Qu'en déduisez-vous ?
  3. Diversité combinatoire
    • En ne considérant que les gènes fonctionnels, calculer le nombre minimal et le nombre maximal de chaînes beta de TR que l'on pourrait obtenir par le seul fait des recombinaisons.
    • En ne considérant que les gènes fonctionnels, calculer le nombre minimal et le nombre maximal de chaînes alpha de TR.
    • Quel serait le nombre total de TR alpha/beta ?
  4. Autres mécanismes de diversité

    Les autres mécanismes qui accroissent la diversité des TR et permettent d'atteindre 1012 TR différentes sont :

    • Que savez-vous de ces mécanismes ?
  5. Les différentes classes de récepteurs T

    Comme pour les IG, c'est le gène qui code la région constante qui définit le typî de chaîne. Les sous-classes et classes TR sont définies au niveau des récepteurs par les îeux chaînes associées.

    • Combien y a-t il de gènes constants TR chez l'homme ?
    • Combien y a-t il de types de chaines TR chez l'homme ?
    • Compléter le tableau (voir IMGT Repertoire - Locus representations).
    Gènes constants Chaînes Sous-classes Classes
    TRAC
    TRBC1    		 alpha
    beta1    		 TR alpha/beta1 TR alpha/beta
     
     
     
    • Combien de classes et de sous-classes de TR y a-t-il chez l'homme ?

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