"+" or "-" indicates if the gene sequences have been found (+) or not been found (-) rearranged (R), transcribed (T) and/or translated into protein (Pr). Arbitrarily that information is shown on the first line of each gene when the data have been confirmed by several studies.
Functionality is shown between parentheses, (F) and (P), when the accession
number refers to rearranged genomic DNA or cDNA and the corresponding germline
gene has not yet been isolated.
Functionality is shown between brackets, [F] and [P], when the accession number
refers to genomic DNA, but not known as being germline or rearranged.
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Although the TRDV1 gene was also found rearranged to a TRAJ gene and therefore expressed with the TRAC gene [12,13] (Assignment of rearranged cDNAs), it is considered as a TRDV gene. The first five Homo sapiens TRAV genes found rearranged, not only as expected to TRAJ but also to TRDD-TRDJ genes and with the designation TRAV/DV are reported in the Gene table: Human (Homo sapiens) TRAV. They include Homo sapiens TRAV14/DV4, TRAV29/DV5, TRAV23/DV6, TRAV36/DV7 and TRAV38-2/DV8 genes.
IMGT subgroup | IMGT gene name | IMGT allele name | Fct | Chromosomal localization | R | T | Pr | Positions in the locus | IMGT/LIGM-DB reference sequences | IMGT/LIGM-DB sequences from the literature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | Secondary accession numbers | Clone names | Accession numbers | Positions in the sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRDV1 | TRDV1 | TRDV1*01 | F | 14q11.2 | + | + | + | (6) | Vdelta1 | M22198 | [1] | DV101S1 | U32547 | [8] | (2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AE000660 | [9] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000676.2 | IMGT000024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRDV2 | TRDV2 | TRDV2*01 | F | 14q11.2 | + | + | + | (7) | V2*A1 | X15275 | [4] | (8) | DV102S1 | U32548 | [8] | (2) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X15207 | [3] | (1) | DV102S1 | U32548 | [8] | (2) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRDV2*02 | F | 14q11.2 | V2*A2 | Y13426 | [7] | (2) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRDV2*03 | F | 14q11.2 | + | + | DV102S1 | AE000661 | [9] | Vdelta2 | X53849 | [11] | #c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000676.2 | IMGT000024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRDV3 | TRDV3 | (5) | TRDV3*01 | F | 14q11.2 | + | + | + | V3 | M23326 | [2] | Vdelta3 | X13954 | [5] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DV103S1 | U32549 | [8] | (2,3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
M94081 | [10] | (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DV103S1 | AE000661 | [9] | (4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CM000676.2 | IMGT000024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TRDV3*02 | F | 14q11.2 | Vdelta3 | X15261 | [6] |
#c: Rearranged cDNA.